More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2649 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  99.49 
 
 
392 aa  801    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  100 
 
 
392 aa  806    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
392 aa  806    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  48.2 
 
 
390 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  47.94 
 
 
390 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.34 
 
 
389 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.69 
 
 
389 aa  333  2e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  40.21 
 
 
389 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.82 
 
 
397 aa  295  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  36.91 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.25 
 
 
394 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.25 
 
 
394 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.25 
 
 
394 aa  247  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.53 
 
 
394 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.05 
 
 
391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.86 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.31 
 
 
394 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.64 
 
 
388 aa  232  7.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.35 
 
 
397 aa  227  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.73 
 
 
390 aa  226  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.6 
 
 
390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  32.99 
 
 
402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.91 
 
 
410 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.98 
 
 
400 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.52 
 
 
388 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  32.26 
 
 
413 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.76 
 
 
399 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.52 
 
 
403 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.52 
 
 
403 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.7 
 
 
393 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.7 
 
 
393 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.7 
 
 
393 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  32.99 
 
 
415 aa  206  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  34.31 
 
 
405 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.87 
 
 
393 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.97 
 
 
393 aa  204  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  33.79 
 
 
406 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.86 
 
 
394 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.61 
 
 
421 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.7 
 
 
389 aa  189  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.67 
 
 
407 aa  188  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.28 
 
 
404 aa  188  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.7 
 
 
387 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.7 
 
 
388 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.7 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.7 
 
 
387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  31.61 
 
 
402 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.34 
 
 
393 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.32 
 
 
392 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.06 
 
 
370 aa  169  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.02 
 
 
391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.49 
 
 
392 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.23 
 
 
397 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  29.92 
 
 
409 aa  161  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.71 
 
 
396 aa  159  8e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  32.3 
 
 
370 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  31.45 
 
 
397 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  29.94 
 
 
636 aa  152  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.55 
 
 
418 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.72 
 
 
394 aa  149  8e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.26 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 
397 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.52 
 
 
390 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.41 
 
 
387 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.76 
 
 
397 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.96 
 
 
397 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.72 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.96 
 
 
397 aa  138  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.65 
 
 
394 aa  138  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.25 
 
 
397 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.98 
 
 
410 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.84 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.95 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.2 
 
 
391 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  30.32 
 
 
409 aa  133  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.89 
 
 
394 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  29.78 
 
 
381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  27.88 
 
 
398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  28.02 
 
 
393 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.95 
 
 
384 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.74 
 
 
393 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.11 
 
 
392 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.53 
 
 
404 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  29.41 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.76 
 
 
386 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.41 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  25.75 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.65 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.65 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.65 
 
 
391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.36 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  26.6 
 
 
427 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.97 
 
 
405 aa  113  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.13 
 
 
389 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.2 
 
 
399 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.67 
 
 
397 aa  111  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.98 
 
 
388 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.84 
 
 
386 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  27.42 
 
 
415 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>