283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0696 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  838    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.11 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  34.84 
 
 		 390 aa  217  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.79 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.79 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.79 
 
 		 392 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.51 
 
 		 421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 404 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  33.06 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.1 
 
 		 391 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.98 
 
 		 389 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  30.68 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  30.35 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.53 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.11 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  32.02 
 
 		 409 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.84 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.84 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.97 
 
 		 397 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.28 
 
 		 393 aa  179  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.99 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.99 
 
 		 393 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  33.71 
 
 		 405 aa  178  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.84 
 
 		 399 aa  177  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.87 
 
 		 418 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  30.98 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.96 
 
 		 390 aa  177  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  31.91 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.86 
 
 		 390 aa  176  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.99 
 
 		 397 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.18 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.66 
 
 		 390 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.55 
 
 		 410 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.92 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.91 
 
 		 400 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.4 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.63 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  30.59 
 
 		 415 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  30.81 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.19 
 
 		 388 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.25 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.89 
 
 		 396 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  29.4 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.61 
 
 		 402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.49 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.49 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.49 
 
 		 394 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.29 
 
 		 394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.42 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.07 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.95 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.65 
 
 		 393 aa  160  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  29.7 
 
 		 636 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.75 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.57 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.57 
 
 		 403 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.04 
 
 		 394 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.69 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.13 
 
 		 397 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.13 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.33 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.09 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.24 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.9 
 
 		 397 aa  147  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  29.6 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.45 
 
 		 392 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.7 
 
 		 392 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.49 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.53 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.53 
 
 		 399 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.39 
 
 		 399 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.4 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  29.59 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.63 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.37 
 
 		 393 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  26.74 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.49 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.87 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  28.49 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.15 
 
 		 386 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.19 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.91 
 
 		 389 aa  126  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  26.6 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.53 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.35 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.65 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  27.81 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 		 377 aa  119  9e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  23.94 
 
 		 405 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.15 
 
 		 387 aa  116  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.79 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.07 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  24.93 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.07 
 
 		 391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>