More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4085 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 394 aa  796    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  64.47 
 
 		 394 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.22 
 
 		 390 aa  462  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  56.6 
 
 		 392 aa  451  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  54.31 
 
 		 393 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.02 
 
 		 392 aa  426  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.22 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.76 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.67 
 
 		 396 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.23 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.66 
 
 		 418 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  33.42 
 
 		 405 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.29 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.29 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.29 
 
 		 394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  30.87 
 
 		 402 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.3 
 
 		 399 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.79 
 
 		 394 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.07 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  30.05 
 
 		 394 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.28 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  28.95 
 
 		 406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  30.46 
 
 		 427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.45 
 
 		 394 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.23 
 
 		 390 aa  162  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  33.33 
 
 		 636 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.55 
 
 		 390 aa  160  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.35 
 
 		 388 aa  160  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.35 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.82 
 
 		 388 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.31 
 
 		 389 aa  157  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.16 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.89 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.89 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.89 
 
 		 387 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.18 
 
 		 388 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.13 
 
 		 404 aa  150  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  29.23 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.53 
 
 		 389 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  28.87 
 
 		 415 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.73 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.35 
 
 		 398 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  27.01 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.13 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  28.68 
 
 		 393 aa  140  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.13 
 
 		 390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.13 
 
 		 394 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.36 
 
 		 392 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  28.32 
 
 		 413 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  29.87 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.43 
 
 		 397 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.61 
 
 		 394 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.89 
 
 		 392 aa  136  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.2 
 
 		 407 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.89 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.89 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.98 
 
 		 397 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  28.61 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.13 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  27.13 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.48 
 
 		 391 aa  126  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  27.06 
 
 		 427 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  28.39 
 
 		 468 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.92 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.92 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.22 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.75 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  25.96 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.96 
 
 		 393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.79 
 
 		 399 aa  119  9e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  29.43 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  30.34 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.79 
 
 		 397 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.71 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.32 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.01 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  25.13 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.88 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.46 
 
 		 393 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.35 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  26.84 
 
 		 405 aa  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.99 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.29 
 
 		 397 aa  106  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.23 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.23 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.23 
 
 		 391 aa  105  9e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.51 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.53 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.14 
 
 		 397 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.12 
 
 		 397 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.76 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  23.92 
 
 		 385 aa  101  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.76 
 
 		 434 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  28.3 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.13 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.2 
 
 		 397 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.8 
 
 		 391 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.08 
 
 		 388 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.65 
 
 		 386 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.3 
 
 		 404 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>