247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5306 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 421 aa  864    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  47.57 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  44.63 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  47.19 
 
 		 410 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.43 
 
 		 391 aa  263  4.999999999999999e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  36.55 
 
 		 402 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.58 
 
 		 390 aa  249  5e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.54 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  36.81 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.63 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.63 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.63 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.73 
 
 		 394 aa  244  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  35.75 
 
 		 394 aa  242  7e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  34.2 
 
 		 397 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.85 
 
 		 394 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.46 
 
 		 399 aa  233  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.59 
 
 		 394 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.94 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  35 
 
 		 409 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.35 
 
 		 407 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  33.59 
 
 		 402 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.4 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.25 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.51 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  31.94 
 
 		 413 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  34.2 
 
 		 405 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 		 390 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33 
 
 		 392 aa  202  8e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  31.51 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.24 
 
 		 403 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  33.16 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.61 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.61 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.61 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.59 
 
 		 396 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.46 
 
 		 400 aa  192  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.77 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  32.43 
 
 		 636 aa  187  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.47 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.51 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.26 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.23 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.24 
 
 		 389 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.52 
 
 		 391 aa  176  6e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.5 
 
 		 394 aa  176  8e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  34.89 
 
 		 370 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.77 
 
 		 388 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.33 
 
 		 394 aa  170  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.14 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  31.38 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.62 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.62 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.62 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.62 
 
 		 393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.3 
 
 		 393 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.33 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.69 
 
 		 391 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.82 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  27.08 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.38 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.38 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.32 
 
 		 392 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  30.79 
 
 		 377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.8 
 
 		 404 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.37 
 
 		 393 aa  143  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  27.37 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.08 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  29.92 
 
 		 415 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.99 
 
 		 413 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.94 
 
 		 395 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.38 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.72 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  28.2 
 
 		 429 aa  139  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  26.03 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  29.53 
 
 		 381 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 		 370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.85 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.4 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.45 
 
 		 397 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.96 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 		 397 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.57 
 
 		 397 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  25.71 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  27.66 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.7 
 
 		 396 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.03 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.61 
 
 		 387 aa  126  9e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.24 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.92 
 
 		 399 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.03 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  22.79 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.18 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.56 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  24.63 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  24.88 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.4 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>