More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_32180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  78.41 
 
 
389 aa  661    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  100 
 
 
389 aa  816    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  70.69 
 
 
389 aa  605  9.999999999999999e-173  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  63.02 
 
 
390 aa  535  1e-151  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  63.02 
 
 
390 aa  536  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.47 
 
 
392 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.21 
 
 
392 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.21 
 
 
392 aa  332  6e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.34 
 
 
397 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  32.99 
 
 
402 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  34.29 
 
 
394 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.82 
 
 
394 aa  217  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
394 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.25 
 
 
394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
394 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.31 
 
 
388 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.76 
 
 
391 aa  209  9e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.36 
 
 
394 aa  202  7e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.47 
 
 
410 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  33.06 
 
 
406 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.87 
 
 
388 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.07 
 
 
390 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.9 
 
 
390 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  31.28 
 
 
405 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.29 
 
 
397 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.91 
 
 
399 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  29.35 
 
 
402 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.79 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.97 
 
 
394 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  28.76 
 
 
409 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.21 
 
 
397 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.75 
 
 
393 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  29.53 
 
 
415 aa  170  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.32 
 
 
400 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  29.38 
 
 
413 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.75 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.85 
 
 
393 aa  165  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.69 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.69 
 
 
393 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.69 
 
 
393 aa  163  6e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.27 
 
 
396 aa  162  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  30.11 
 
 
409 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.89 
 
 
388 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.08 
 
 
421 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.11 
 
 
392 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.39 
 
 
418 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.26 
 
 
407 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.91 
 
 
387 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.91 
 
 
387 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.91 
 
 
387 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  29.27 
 
 
397 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.19 
 
 
392 aa  150  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.84 
 
 
393 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.61 
 
 
394 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.65 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.08 
 
 
392 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.32 
 
 
403 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.32 
 
 
403 aa  140  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.08 
 
 
390 aa  139  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.01 
 
 
394 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.37 
 
 
370 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.79 
 
 
391 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  29.45 
 
 
370 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.57 
 
 
395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.25 
 
 
394 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.24 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.22 
 
 
391 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  24.55 
 
 
433 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  24.78 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  25 
 
 
636 aa  113  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.71 
 
 
396 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.41 
 
 
410 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  26.86 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.83 
 
 
404 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  27.07 
 
 
377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
397 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.34 
 
 
397 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.07 
 
 
397 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  24.09 
 
 
393 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.06 
 
 
392 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.34 
 
 
397 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  25.68 
 
 
468 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.9 
 
 
397 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.27 
 
 
386 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  24.36 
 
 
427 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  25.82 
 
 
398 aa  102  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.51 
 
 
399 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  26.11 
 
 
429 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.57 
 
 
387 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.67 
 
 
386 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.14 
 
 
389 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.59 
 
 
397 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.9 
 
 
399 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.01 
 
 
405 aa  99.8  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  25.5 
 
 
405 aa  99.8  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  24.44 
 
 
427 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.88 
 
 
405 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  24.43 
 
 
415 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.51 
 
 
376 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>