More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1773 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  100 
 
 
636 aa  1261    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3980  GTP cyclohydrolase II  74.41 
 
 
235 aa  319  9e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0125  GTP cyclohydrolase II  73.4 
 
 
206 aa  303  9e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.138767  normal  0.547527 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2559  GTP cyclohydrolase II  64.73 
 
 
214 aa  270  7e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.300665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2747  GTP cyclohydrolase II  64.93 
 
 
214 aa  270  8.999999999999999e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.218469  hitchhiker  0.000822129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1820  GTP cyclohydrolase II  62.62 
 
 
229 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1684  GTP cyclohydrolase II  64.68 
 
 
200 aa  256  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.106348  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3851  GTP cyclohydrolase II  58.94 
 
 
226 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000876252  decreased coverage  0.00498472 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2026  GTP cyclohydrolase II  54.73 
 
 
202 aa  219  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1285  GTP cyclohydrolase II  53.62 
 
 
218 aa  211  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.646726  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1629  GTP cyclohydrolase II  54.59 
 
 
214 aa  211  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02717  GTP cyclohydrolase II  47.49 
 
 
215 aa  210  6e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1048  GTP cyclohydrolase II  53.62 
 
 
214 aa  210  7e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715074  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1584  GTP cyclohydrolase II  53.62 
 
 
214 aa  210  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.844729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0379  GTP cyclohydrolase II  53.62 
 
 
218 aa  210  7e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.676581  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0035  GTP cyclohydrolase II  53.62 
 
 
205 aa  210  8e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003122  GTP cyclohydrolase II  47.69 
 
 
218 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0882  GTP cyclohydrolase II  48.1 
 
 
216 aa  207  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0406988  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0062  GTP cyclohydrolase II  49.5 
 
 
198 aa  205  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.35524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1205  GTP cyclohydrolase II  55.68 
 
 
195 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0081  GTP cyclohydrolase II  55.68 
 
 
195 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1501  GTP cyclohydrolase II  55.68 
 
 
195 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.23357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.56 
 
 
391 aa  196  8.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3789  GTP cyclohydrolase II  56.08 
 
 
353 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.53 
 
 
387 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  37.27 
 
 
387 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.27 
 
 
387 aa  192  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0824  GTP cyclohydrolase II  57.43 
 
 
397 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0866  GTP cyclohydrolase II  52.74 
 
 
215 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1787  GTP cyclohydrolase II  50.55 
 
 
199 aa  189  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.52 
 
 
421 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
402 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.77 
 
 
392 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2672  GTP cyclohydrolase II  51.34 
 
 
300 aa  181  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.371178  normal  0.94749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2767  GTP cyclohydrolase II  61.33 
 
 
407 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0115605  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3191  GTP cyclohydrolase II  51.3 
 
 
354 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0518  GTP cyclohydrolase II  44.39 
 
 
200 aa  179  1e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.796471  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1824  GTP cyclohydrolase II  44.93 
 
 
204 aa  178  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.228717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1417  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  48.07 
 
 
396 aa  178  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0043  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  44.22 
 
 
373 aa  178  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  31.96 
 
 
393 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3022  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  48.22 
 
 
400 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.225515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1690  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II  52.51 
 
 
400 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.632341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.2 
 
 
394 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1228  GTP cyclohydrolase II  48.22 
 
 
400 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00154476 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0748  riboflavin biosynthesis protein RibA  54.39 
 
 
397 aa  175  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.847845  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0762  riboflavin biosynthesis protein RibA  52.78 
 
 
406 aa  175  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0658  3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase  52.78 
 
 
406 aa  174  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2181  GTP cyclohydrolase II  50.28 
 
 
400 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00037969  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1159  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  42.73 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.47 
 
 
394 aa  174  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2729  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  51.11 
 
 
425 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1188  riboflavin biosynthesis protein RibA  48.6 
 
 
402 aa  173  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1521  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  46.96 
 
 
399 aa  172  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1626  GTP cyclohydrolase II / 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  51.11 
 
 
400 aa  173  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177165  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.91 
 
 
390 aa  173  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1677  GTP cyclohydrolase II  58.24 
 
 
237 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1182  riboflavin biosynthesis protein RibA  48.6 
 
 
402 aa  172  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1652  GTP cyclohydrolase II  47.94 
 
 
401 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000854469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0532  riboflavin biosynthesis protein RibA  52.94 
 
 
399 aa  171  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0999  GTP cyclohydrolase II  50 
 
 
403 aa  171  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.858453  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0938  GTP cyclohydrolase II  51.11 
 
 
396 aa  171  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.58 
 
 
388 aa  171  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0541  GTP cyclohydrolase II  50 
 
 
248 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_971  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II  49.49 
 
 
432 aa  171  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000135166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0931  bifunctional protein: GTP cyclohydrolase II; 3,4 dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase  47.22 
 
 
405 aa  171  5e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0340285 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0244  GTP cyclohydrolase II  44.6 
 
 
224 aa  170  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10010  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  47.72 
 
 
404 aa  170  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0220  GTP cyclohydrolase II  43.84 
 
 
230 aa  170  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0935071 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0422  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  57.14 
 
 
400 aa  170  8e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.717648  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0881  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  50.84 
 
 
399 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0166  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase / GTP cyclohydrolase II  45.6 
 
 
408 aa  170  8e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1188  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II  48.98 
 
 
403 aa  170  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0674576  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1289  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  51.38 
 
 
400 aa  170  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2476  riboflavin-specific deaminase/GTP cyclohydrolase II  56.29 
 
 
355 aa  169  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1751  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  47.4 
 
 
401 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.020709  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4241  GTP cyclohydrolase II  53.93 
 
 
198 aa  169  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.25 
 
 
397 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0537  GTP cyclohydrolase II  49.51 
 
 
248 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.580744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2740  GTP cyclohydrolase II  49.72 
 
 
440 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.358954  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.08 
 
 
390 aa  168  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2091  GTP cyclohydrolase II  50 
 
 
410 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0548  riboflavin biosynthesis protein RibA  51.63 
 
 
399 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.913835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2077  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  43.07 
 
 
404 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0721218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0917  GTP cyclohydrolase II  48.33 
 
 
403 aa  167  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00160336  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0194  GTP cyclohydrolase II  54.49 
 
 
198 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08550  3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase  47.51 
 
 
404 aa  167  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1272  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  57.42 
 
 
425 aa  167  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.458988 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0508  GTP cyclohydrolase II  51.26 
 
 
248 aa  167  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.650511  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1672  GTP cyclohydrolase II  59.21 
 
 
243 aa  167  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.96867e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1080  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  49.75 
 
 
410 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2237  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  50 
 
 
397 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0022  GTP cyclohydrolase II  43.92 
 
 
396 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.97 
 
 
394 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.97 
 
 
394 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1299  GTP cyclohydrolase II  53.76 
 
 
206 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00104541  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  33.5 
 
 
409 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0387  bifunctional 3,4-dihydroxy-2-butanone 4-phosphate synthase/GTP cyclohydrolase II protein  50 
 
 
397 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.97 
 
 
394 aa  166  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1074  GTP cyclohydrolase II  44.44 
 
 
398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.554349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>