278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1618 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  100 
 
 		 387 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  99.48 
 
 		 387 aa  766    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 387 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  74.67 
 
 		 388 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  70.83 
 
 		 392 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  37.27 
 
 		 636 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.97 
 
 		 392 aa  195  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.7 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.7 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.07 
 
 		 390 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.22 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.22 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.22 
 
 		 394 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  31.84 
 
 		 406 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.69 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.77 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.64 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 		 390 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.29 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.76 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.13 
 
 		 389 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.33 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.75 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.46 
 
 		 397 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  30.55 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.07 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.89 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.25 
 
 		 399 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  32.1 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.19 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  29.26 
 
 		 413 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.06 
 
 		 421 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  30.91 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.68 
 
 		 393 aa  160  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.53 
 
 		 388 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.89 
 
 		 394 aa  159  6e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  33.33 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  30.4 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  31.47 
 
 		 415 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.02 
 
 		 392 aa  154  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.93 
 
 		 410 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.61 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.17 
 
 		 403 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.25 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.6 
 
 		 391 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  29.4 
 
 		 393 aa  139  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.41 
 
 		 392 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.09 
 
 		 395 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  27.15 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.41 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.42 
 
 		 399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.43 
 
 		 389 aa  130  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.92 
 
 		 393 aa  125  9e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.14 
 
 		 418 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.54 
 
 		 393 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.27 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.27 
 
 		 393 aa  123  5e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  30.59 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.54 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.72 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.77 
 
 		 404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.61 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  29.82 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.65 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  30.18 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.18 
 
 		 387 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.37 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.2 
 
 		 413 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  30.2 
 
 		 381 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.4 
 
 		 397 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.06 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.79 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.42 
 
 		 386 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.8 
 
 		 384 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  27.78 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.88 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  31.1 
 
 		 377 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.84 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 393 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.47 
 
 		 397 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  27.15 
 
 		 393 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  24.08 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.92 
 
 		 388 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.96 
 
 		 391 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.47 
 
 		 397 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.93 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.77 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.2 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.54 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.04 
 
 		 405 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.95 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.95 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.95 
 
 		 391 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  27.9 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  25.98 
 
 		 405 aa  97.8  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>