184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0333 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  796    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.31 
 
 
410 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  26.7 
 
 
402 aa  124  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  28.07 
 
 
405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.79 
 
 
421 aa  119  9e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.69 
 
 
390 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.65 
 
 
390 aa  116  6e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  28.53 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.01 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.41 
 
 
391 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  26.19 
 
 
406 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.74 
 
 
404 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  28.04 
 
 
409 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.16 
 
 
388 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.81 
 
 
397 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.1 
 
 
394 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.1 
 
 
394 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.42 
 
 
394 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.1 
 
 
394 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  25.41 
 
 
394 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.42 
 
 
394 aa  101  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  24.49 
 
 
413 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.23 
 
 
388 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  23.97 
 
 
410 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.83 
 
 
397 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.07 
 
 
394 aa  99.8  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.79 
 
 
394 aa  99.8  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.61 
 
 
387 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.75 
 
 
400 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.93 
 
 
361 aa  96.3  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.89 
 
 
392 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.35 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.35 
 
 
387 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  23.73 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.73 
 
 
392 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.2 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  26.11 
 
 
636 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.86 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.31 
 
 
407 aa  90.9  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.96 
 
 
393 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.2 
 
 
390 aa  90.1  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.54 
 
 
393 aa  90.1  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.3 
 
 
404 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  28.46 
 
 
383 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  25.27 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.27 
 
 
393 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.04 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.12 
 
 
396 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.04 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  25.07 
 
 
393 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  25.27 
 
 
409 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  23.34 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.57 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.03 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.58 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  25.88 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.81 
 
 
394 aa  84  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.68 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.49 
 
 
397 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.68 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  28.68 
 
 
398 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.98 
 
 
393 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  23.45 
 
 
389 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.94 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.5 
 
 
404 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.54 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.51 
 
 
405 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  21.68 
 
 
389 aa  80.5  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.93 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  25.39 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.39 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.98 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.98 
 
 
403 aa  79  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.58 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.85 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  25.51 
 
 
381 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.47 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.99 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.83 
 
 
395 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0955  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.21 
 
 
398 aa  77  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  22.08 
 
 
402 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  21.55 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.24 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.7 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.53 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  21.75 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  26.23 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  26.15 
 
 
377 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.12 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.64 
 
 
391 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.32 
 
 
396 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.99 
 
 
394 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0523  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.61 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.07 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.13 
 
 
397 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.19 
 
 
433 aa  67  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  25.39 
 
 
427 aa  67  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  21.97 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  24.32 
 
 
433 aa  63.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>