More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3519 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 
394 aa  801    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.9 
 
 
393 aa  510  1e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.39 
 
 
393 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  59.14 
 
 
393 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  59.14 
 
 
393 aa  504  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.88 
 
 
393 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  41.45 
 
 
394 aa  292  9e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.82 
 
 
391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.63 
 
 
394 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  40.69 
 
 
394 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.69 
 
 
394 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.69 
 
 
394 aa  281  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.89 
 
 
394 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  39.84 
 
 
394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.89 
 
 
390 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.27 
 
 
388 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.35 
 
 
388 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.64 
 
 
390 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  35.79 
 
 
402 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  37.28 
 
 
397 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.12 
 
 
399 aa  232  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  38.3 
 
 
413 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.73 
 
 
407 aa  215  8e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.62 
 
 
400 aa  211  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  34.71 
 
 
410 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.91 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.91 
 
 
403 aa  200  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.86 
 
 
392 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  35.86 
 
 
392 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.86 
 
 
392 aa  199  6e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.64 
 
 
391 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.43 
 
 
389 aa  186  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.25 
 
 
397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.58 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  33.8 
 
 
390 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  31.08 
 
 
415 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.98 
 
 
390 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.85 
 
 
370 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  29.97 
 
 
389 aa  172  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.31 
 
 
397 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  30.03 
 
 
397 aa  170  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.27 
 
 
404 aa  170  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.14 
 
 
421 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.53 
 
 
391 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  30.9 
 
 
402 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.29 
 
 
406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  31.21 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.18 
 
 
389 aa  156  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.53 
 
 
393 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.25 
 
 
394 aa  148  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.14 
 
 
394 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.54 
 
 
392 aa  145  9e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  30.85 
 
 
636 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  28.48 
 
 
405 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.73 
 
 
390 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.79 
 
 
404 aa  140  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  30.64 
 
 
409 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.61 
 
 
394 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.65 
 
 
393 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  29.91 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.97 
 
 
397 aa  129  9.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.05 
 
 
396 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.64 
 
 
392 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  29.27 
 
 
468 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.63 
 
 
418 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.92 
 
 
386 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.08 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.14 
 
 
389 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
387 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.98 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.8 
 
 
392 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.2 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.61 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.61 
 
 
387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.75 
 
 
397 aa  116  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.91 
 
 
388 aa  117  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.7 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.7 
 
 
397 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.8 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.9 
 
 
398 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  26.91 
 
 
383 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.22 
 
 
393 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.97 
 
 
386 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.45 
 
 
399 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  28.57 
 
 
415 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  27.25 
 
 
398 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  26.36 
 
 
433 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.57 
 
 
399 aa  110  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  28.12 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.38 
 
 
392 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.12 
 
 
388 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.63 
 
 
396 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.99 
 
 
376 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.21 
 
 
395 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.63 
 
 
387 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  25.14 
 
 
427 aa  102  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.59 
 
 
413 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  26.49 
 
 
424 aa  101  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.45 
 
 
405 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>