More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2879 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 		 390 aa  797    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  92.82 
 
 		 390 aa  719    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  63.95 
 
 		 391 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  58.55 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  55.78 
 
 		 394 aa  452  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  52.97 
 
 		 402 aa  434  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  53.75 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.49 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  53.49 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  53.49 
 
 		 394 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  52.34 
 
 		 388 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.68 
 
 		 394 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  51.68 
 
 		 394 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  41.46 
 
 		 397 aa  288  8e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.53 
 
 		 399 aa  287  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  43.36 
 
 		 400 aa  283  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.78 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  41.78 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  42.28 
 
 		 413 aa  280  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.2 
 
 		 407 aa  270  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  40.64 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.68 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  39.41 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.41 
 
 		 393 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  38.54 
 
 		 421 aa  262  8e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.84 
 
 		 393 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.5 
 
 		 393 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  36.73 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.73 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.73 
 
 		 392 aa  240  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.47 
 
 		 397 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.98 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  37.89 
 
 		 404 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  38.62 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  36.1 
 
 		 409 aa  229  9e-59  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  37.24 
 
 		 410 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  34.69 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  34.13 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  36.58 
 
 		 390 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.32 
 
 		 390 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.78 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.44 
 
 		 389 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  40.11 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  36.04 
 
 		 405 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.31 
 
 		 389 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  36.39 
 
 		 370 aa  209  5e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  36.36 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.62 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  33.77 
 
 		 389 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  32.96 
 
 		 406 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.42 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.42 
 
 		 387 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  33.42 
 
 		 393 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.95 
 
 		 394 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.72 
 
 		 388 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.35 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  32.82 
 
 		 636 aa  177  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  34.56 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.46 
 
 		 396 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.34 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.23 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32 
 
 		 392 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.08 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.19 
 
 		 418 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.18 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.43 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.26 
 
 		 395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.96 
 
 		 404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.32 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.68 
 
 		 387 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.45 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  28.34 
 
 		 377 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.4 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.37 
 
 		 396 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.2 
 
 		 397 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  29.28 
 
 		 381 aa  133  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  27.7 
 
 		 383 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  28.42 
 
 		 393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.7 
 
 		 389 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.31 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  29.53 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.34 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.95 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.82 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  29.61 
 
 		 427 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.3 
 
 		 392 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  27.69 
 
 		 393 aa  122  8e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  30.85 
 
 		 427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.81 
 
 		 413 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.34 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.65 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.75 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.35 
 
 		 393 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.18 
 
 		 386 aa  115  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.6 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.59 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.61 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  27.34 
 
 		 433 aa  112  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  27.96 
 
 		 415 aa  112  9e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>