More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4447 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 398 aa  800    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.08 
 
 		 396 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.57 
 
 		 390 aa  149  6e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.38 
 
 		 394 aa  139  7e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.16 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.88 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.88 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.88 
 
 		 394 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.09 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.22 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.31 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.88 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.09 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.4 
 
 		 421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  27.88 
 
 		 418 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  28.07 
 
 		 394 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.93 
 
 		 394 aa  129  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29 
 
 		 393 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.52 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 402 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.91 
 
 		 392 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.8 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  30.58 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.95 
 
 		 393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  28.25 
 
 		 402 aa  119  9e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  31.52 
 
 		 370 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.83 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.83 
 
 		 393 aa  116  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  28.07 
 
 		 427 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  28.01 
 
 		 397 aa  116  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.58 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.56 
 
 		 393 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.65 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.53 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.9 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.08 
 
 		 392 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.1 
 
 		 393 aa  113  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.32 
 
 		 410 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.48 
 
 		 404 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.81 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  27.27 
 
 		 406 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.6 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 		 400 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  27.11 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.82 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.82 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.82 
 
 		 392 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  28.83 
 
 		 409 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.89 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.09 
 
 		 361 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.82 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.91 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  27.99 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.69 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  26.33 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.78 
 
 		 397 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  26.07 
 
 		 468 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.13 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.48 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  28.07 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.63 
 
 		 391 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.15 
 
 		 397 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.07 
 
 		 370 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.29 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.17 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.17 
 
 		 403 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.38 
 
 		 388 aa  99.8  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  29.29 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  28.94 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.43 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.58 
 
 		 386 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.35 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.35 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.06 
 
 		 434 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  29.38 
 
 		 636 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.46 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.46 
 
 		 390 aa  96.3  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.5 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.99 
 
 		 397 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.75 
 
 		 397 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.12 
 
 		 395 aa  94.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.94 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  25.13 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.07 
 
 		 397 aa  92.8  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.67 
 
 		 405 aa  91.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 		 388 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  26.09 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.65 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.62 
 
 		 410 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  24.8 
 
 		 415 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.12 
 
 		 376 aa  89.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.35 
 
 		 389 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.98 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.94 
 
 		 391 aa  86.7  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.81 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.8 
 
 		 387 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.87 
 
 		 388 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>