More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2312 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
404 aa  820    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.19 
 
 
391 aa  166  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  29.63 
 
 
402 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.59 
 
 
390 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.06 
 
 
421 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.59 
 
 
388 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.5 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  31.13 
 
 
415 aa  151  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.79 
 
 
394 aa  150  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.96 
 
 
390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.27 
 
 
388 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  30.03 
 
 
409 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  32.04 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.04 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  30.63 
 
 
406 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.04 
 
 
393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.73 
 
 
393 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.96 
 
 
394 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.83 
 
 
393 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.7 
 
 
399 aa  140  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  29.27 
 
 
390 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 
391 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.84 
 
 
394 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.84 
 
 
394 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.84 
 
 
394 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 
390 aa  137  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  27.15 
 
 
394 aa  137  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.88 
 
 
392 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.12 
 
 
394 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.61 
 
 
392 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.61 
 
 
392 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  27.53 
 
 
413 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.55 
 
 
407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.01 
 
 
410 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.61 
 
 
394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  30.79 
 
 
409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.95 
 
 
389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  29.12 
 
 
397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 
387 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.85 
 
 
397 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.86 
 
 
394 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  27.2 
 
 
402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.77 
 
 
387 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.77 
 
 
387 aa  126  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.11 
 
 
390 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  29.79 
 
 
405 aa  124  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.11 
 
 
389 aa  124  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  30.29 
 
 
418 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.23 
 
 
400 aa  123  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  26.18 
 
 
370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  26.83 
 
 
389 aa  121  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.69 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.2 
 
 
392 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.99 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  27.99 
 
 
636 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.41 
 
 
404 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.41 
 
 
397 aa  113  5e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.61 
 
 
397 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.93 
 
 
397 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.67 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.41 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  29.27 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.41 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.75 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  27.25 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.75 
 
 
403 aa  111  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.13 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  36.55 
 
 
392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  26.84 
 
 
398 aa  110  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.56 
 
 
394 aa  110  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  26.89 
 
 
393 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  39.26 
 
 
391 aa  108  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.5 
 
 
392 aa  107  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.09 
 
 
392 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
389 aa  105  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.39 
 
 
399 aa  103  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.4 
 
 
410 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.62 
 
 
395 aa  96.7  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.72 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0333  hypothetical protein  24.59 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.512577 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.81 
 
 
394 aa  94  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.55 
 
 
370 aa  92  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.25 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.25 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.25 
 
 
391 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  26.16 
 
 
377 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.14 
 
 
396 aa  90.5  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.99 
 
 
393 aa  90.1  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  24.94 
 
 
415 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.29 
 
 
393 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.26 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.69 
 
 
389 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.92 
 
 
413 aa  87  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.42 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  29.71 
 
 
383 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.61 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.51 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.32 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  25.94 
 
 
405 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.42 
 
 
388 aa  77.8  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>