More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1234 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  100 
 
 		 370 aa  737    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4102  Acyl-CoA dehydrogenase  44.61 
 
 		 381 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6489  ccyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  41.31 
 
 		 387 aa  229  5e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  39.79 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  36.91 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  37.11 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  35.75 
 
 		 421 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  36.73 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.15 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  34.15 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.15 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  34.73 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.61 
 
 		 394 aa  182  7e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.25 
 
 		 390 aa  180  4.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.97 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  34.22 
 
 		 415 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  32.52 
 
 		 394 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 		 392 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  33.06 
 
 		 392 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.06 
 
 		 392 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  33.6 
 
 		 397 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.56 
 
 		 404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.8 
 
 		 396 aa  162  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.99 
 
 		 407 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  33.89 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  31.68 
 
 		 413 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.43 
 
 		 388 aa  159  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.73 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  31.32 
 
 		 418 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.08 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.63 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  30.08 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  28.69 
 
 		 389 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.6 
 
 		 397 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.63 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  31.96 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  38.53 
 
 		 400 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.78 
 
 		 390 aa  142  9e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  29.14 
 
 		 406 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.98 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.56 
 
 		 399 aa  141  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.64 
 
 		 397 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.12 
 
 		 394 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.71 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.71 
 
 		 403 aa  139  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.04 
 
 		 397 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.97 
 
 		 393 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.84 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.05 
 
 		 391 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.88 
 
 		 398 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  32.22 
 
 		 393 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3704  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.03 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.49 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.27 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  33.15 
 
 		 409 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.47 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  30.71 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.34 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2312  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.3 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0231485 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  33.96 
 
 		 636 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.79 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  30 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5026  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.48 
 
 		 410 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.931169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.47 
 
 		 393 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 		 393 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.47 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0209  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.46 
 
 		 391 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  30.3 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.12 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.15 
 
 		 386 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.06 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.45 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.25 
 
 		 392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.99 
 
 		 387 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.78 
 
 		 388 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.31 
 
 		 395 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  28.25 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  31.7 
 
 		 413 aa  119  7.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.73 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.7 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.7 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1900  acyl-CoA dehydrogenase type 2  35.05 
 
 		 388 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.25 
 
 		 389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  31.96 
 
 		 415 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.39 
 
 		 394 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  31.18 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.71 
 
 		 433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  31.22 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.9 
 
 		 387 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.7 
 
 		 397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.24 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.14 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  26.57 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.03 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  27.47 
 
 		 405 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>