264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3894 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  100 
 
 		 386 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  57.92 
 
 		 386 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.79 
 
 		 387 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  52.83 
 
 		 396 aa  412  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  55.7 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.27 
 
 		 397 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  55.14 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  56.38 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.27 
 
 		 397 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  56.64 
 
 		 389 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.2 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.05 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  55.83 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  51.61 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  51.32 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  49.59 
 
 		 376 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  50.81 
 
 		 388 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.8 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  34.64 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  34.55 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.33 
 
 		 394 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.07 
 
 		 404 aa  159  7e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.28 
 
 		 393 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  32.45 
 
 		 413 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  28.12 
 
 		 413 aa  134  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.73 
 
 		 384 aa  134  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.71 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.71 
 
 		 399 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  28.15 
 
 		 406 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.3 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  29.68 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.68 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.68 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.47 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.45 
 
 		 386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.38 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.8 
 
 		 393 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.71 
 
 		 394 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.03 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  29.82 
 
 		 410 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.92 
 
 		 394 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  27.45 
 
 		 424 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.14 
 
 		 361 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.18 
 
 		 388 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  29.3 
 
 		 405 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  28.61 
 
 		 760 aa  113  6e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  27.97 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27 
 
 		 397 aa  110  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  26.74 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.84 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.14 
 
 		 407 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  26.37 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  27.91 
 
 		 415 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.93 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.93 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.37 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.93 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.34 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  27.61 
 
 		 427 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  28.88 
 
 		 409 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.56 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.44 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.87 
 
 		 399 aa  105  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.75 
 
 		 390 aa  104  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.68 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.21 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  24.27 
 
 		 389 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.78 
 
 		 387 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  28.53 
 
 		 370 aa  103  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.93 
 
 		 394 aa  103  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.48 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.44 
 
 		 389 aa  102  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  25.53 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.78 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.18 
 
 		 393 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.78 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.4 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.12 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.12 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.12 
 
 		 394 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.7 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.86 
 
 		 393 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.57 
 
 		 390 aa  99.8  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.95 
 
 		 411 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  25.54 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  27 
 
 		 427 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4461  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.19 
 
 		 392 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.43 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  25.46 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.52 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.43 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  28.49 
 
 		 405 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.92 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  27.08 
 
 		 383 aa  90.5  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>