276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5530 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  100 
 
 		 433 aa  892    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  74.47 
 
 		 427 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  48.93 
 
 		 468 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  48.02 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  47.67 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.92 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.35 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.86 
 
 		 392 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.54 
 
 		 394 aa  151  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  28.57 
 
 		 393 aa  149  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.95 
 
 		 392 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.4 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  28.86 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.4 
 
 		 397 aa  133  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.15 
 
 		 397 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  27.4 
 
 		 398 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  28.53 
 
 		 392 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.41 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.94 
 
 		 393 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4707  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.5 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.72 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.86 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.46 
 
 		 405 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.52 
 
 		 398 aa  123  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  27.89 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.13 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  28.13 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.13 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.61 
 
 		 397 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  27.74 
 
 		 636 aa  119  9e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.7 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.56 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.25 
 
 		 396 aa  118  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.19 
 
 		 393 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  26.43 
 
 		 402 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.85 
 
 		 394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.49 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.67 
 
 		 394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  27.32 
 
 		 394 aa  113  6e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.3 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.47 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.53 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.63 
 
 		 404 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.26 
 
 		 393 aa  106  8e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.48 
 
 		 393 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.25 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.11 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  25 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 		 393 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.68 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.37 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.82 
 
 		 411 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.49 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.49 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.49 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.7 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.66 
 
 		 388 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 		 384 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  25.13 
 
 		 405 aa  99.4  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  25.5 
 
 		 429 aa  99  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.37 
 
 		 394 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  25.73 
 
 		 406 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  27.14 
 
 		 370 aa  97.1  5e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.15 
 
 		 387 aa  97.4  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.86 
 
 		 394 aa  96.7  7e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7417  oxidoreductase  26.62 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.177501  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.06 
 
 		 413 aa  95.9  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.73 
 
 		 410 aa  96.3  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  25.91 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.94 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.5 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32180  acyl-CoA dehydrogenase protein  25.19 
 
 		 389 aa  94.4  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.06 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.72 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.57 
 
 		 399 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.66 
 
 		 386 aa  93.2  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.25 
 
 		 389 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.75 
 
 		 397 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0955  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.01 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.8 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3342  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.06 
 
 		 410 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6977  acyl-CoA dehydrogenase  24.75 
 
 		 415 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.392428 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.39 
 
 		 391 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.7 
 
 		 389 aa  86.7  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.51 
 
 		 399 aa  86.7  8e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  24.48 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.64 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  23.56 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.56 
 
 		 399 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  29.33 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2060  Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal type2  24.7 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000000186324  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.98 
 
 		 397 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1594  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.85 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1618  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.85 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.624215 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5014  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.36 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2720  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.08 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.186309  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1564  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.85 
 
 		 387 aa  83.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  27.64 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>