141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4006 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
411 aa  852    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  31.88 
 
 
399 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.88 
 
 
399 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  30.08 
 
 
760 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.24 
 
 
386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.63 
 
 
384 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  27.47 
 
 
391 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.47 
 
 
391 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.47 
 
 
391 aa  156  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.32 
 
 
413 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  30.02 
 
 
468 aa  137  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.23 
 
 
393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.31 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  26.82 
 
 
393 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.7 
 
 
376 aa  126  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.38 
 
 
393 aa  124  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  26.07 
 
 
392 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.56 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.33 
 
 
399 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.64 
 
 
394 aa  121  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.92 
 
 
386 aa  121  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  25.59 
 
 
405 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.73 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.61 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  26.95 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.03 
 
 
397 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  26.39 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.04 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  29.08 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.82 
 
 
433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.35 
 
 
397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.08 
 
 
393 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.08 
 
 
393 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.08 
 
 
393 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  25.24 
 
 
427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  27.27 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.61 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.61 
 
 
397 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.26 
 
 
434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.34 
 
 
393 aa  110  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  25.19 
 
 
427 aa  109  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.84 
 
 
404 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.14 
 
 
396 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  23.95 
 
 
398 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.33 
 
 
399 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  26 
 
 
424 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.49 
 
 
407 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  26.7 
 
 
413 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  22.13 
 
 
361 aa  105  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.2 
 
 
394 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  26.93 
 
 
406 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  23.6 
 
 
397 aa  103  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.87 
 
 
392 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
392 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
392 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.33 
 
 
421 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  25.58 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.58 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.58 
 
 
394 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.26 
 
 
389 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.94 
 
 
394 aa  97.4  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  24.94 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.94 
 
 
390 aa  97.1  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.52 
 
 
396 aa  97.1  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.42 
 
 
392 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  29.41 
 
 
636 aa  96.3  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  24.67 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.61 
 
 
394 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.96 
 
 
400 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.32 
 
 
403 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  23.15 
 
 
402 aa  94  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  24.81 
 
 
405 aa  93.2  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.42 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.87 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  23.2 
 
 
393 aa  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.54 
 
 
393 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.42 
 
 
388 aa  90.1  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.19 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0937  putative pigment protein  26 
 
 
409 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.69 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.19 
 
 
390 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  21.59 
 
 
390 aa  86.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4447  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  25.62 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  23.64 
 
 
397 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.59 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  23.04 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  22.56 
 
 
394 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.4 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.4 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5725  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  27.27 
 
 
410 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  25.22 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7405  Acyl-CoA dehydrogenase  25.86 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.66 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4142  Acyl-CoA dehydrogenase  27.25 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.715753  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3406  Acyl-CoA dehydrogenase  25.9 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.94 
 
 
391 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3188  acyl-CoA dehydrogenase type 2  20.81 
 
 
389 aa  77.4  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>