156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1514 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1514  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  100 
 
 
399 aa  811    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376766  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1537  acyl-CoA dehydrogenase type 2  100 
 
 
399 aa  811    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3959  hypothetical protein  36.53 
 
 
760 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6104  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  33.51 
 
 
394 aa  176  9e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4006  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.88 
 
 
411 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3521  acyl-CoA dehydrogenase type 2  34.77 
 
 
397 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0664779 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3905  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.16 
 
 
397 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.936592 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5351  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.51 
 
 
397 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.901542  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5083  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 
397 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.267797 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2500  Acyl-CoA dehydrogenase-like  32.8 
 
 
397 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.284322  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3615  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.07 
 
 
397 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0960663  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3194  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.24 
 
 
384 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351078  normal  0.333251 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5211  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  30.56 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0854163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5299  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.205227  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5591  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.56 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.158031 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2161  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  32.36 
 
 
392 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0323  phenol hydroxylase, putative  32.56 
 
 
398 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.932551  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05205  hypothetical protein  28.79 
 
 
393 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0918769  normal  0.0217925 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6111  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain  31.38 
 
 
405 aa  142  7e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3440  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.97 
 
 
386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.292634  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4200  acyl-CoA dehydrogenase type 2  31.74 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.729166  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1823  acyl-CoA dehydrogenase type 2  29.68 
 
 
396 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0994847  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2308  hypothetical protein  31.58 
 
 
405 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126795  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5077  acyl-CoA dehydrogenase type 2  32.39 
 
 
399 aa  138  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.177468  normal  0.184833 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3894  Acyl-CoA dehydrogenase-like  29.71 
 
 
386 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4295  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.95 
 
 
376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1367  acyl-CoA dehydrogenase type 2  30.36 
 
 
397 aa  124  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2837  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.3 
 
 
399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.360168  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1020  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.41 
 
 
361 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000439336  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3809  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.07 
 
 
387 aa  120  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2207  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.82 
 
 
389 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.853509  normal  0.40701 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1183  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  27.73 
 
 
404 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.576313 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4184  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.65 
 
 
388 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.229185 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2605  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.36 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2649  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 
392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0738  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.81 
 
 
386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.28274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2635  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 
392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.430531  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1010  Acyl-CoA dehydrogenase  28.23 
 
 
405 aa  113  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3621  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  29.02 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3090  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.67 
 
 
404 aa  106  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0412654  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0696  hypothetical protein  25.67 
 
 
406 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.103838  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4780  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.91 
 
 
403 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2892  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.49 
 
 
393 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.846301 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6974  acyl-CoA dehydrogenase-like protein  26.12 
 
 
393 aa  97.4  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.503826 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2129  acyl-CoA dehydrogenase type 2  33.33 
 
 
407 aa  97.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.556044  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3744  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 
390 aa  96.7  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3018  putative acyl-CoA dehydrogenase  25 
 
 
390 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.394232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0309  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.08 
 
 
393 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0318  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  26.81 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193328  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0328  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.81 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.105819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4068  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.94 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0717814  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3519  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.28 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.734065  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13111  hypothetical protein  28.61 
 
 
376 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5062  possible oxidoreductase  24.47 
 
 
427 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0955  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  28.16 
 
 
398 aa  92.4  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5306  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.18 
 
 
421 aa  90.1  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2776  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.93 
 
 
388 aa  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.576785  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3337  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.75 
 
 
400 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0915562 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1567  Acyl-CoA dehydrogenase-like  25.6 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.029301  normal  0.0603177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2133  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  26.42 
 
 
396 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422165  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2555  putative acyl CooA deshydrogenase  23.81 
 
 
424 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.580555 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0933  acyl-CoA dehydrogenase type 2  27.66 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2089  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.51 
 
 
392 aa  88.2  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.878616  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0902  hypothetical protein  25.85 
 
 
402 aa  87.4  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000160111  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4085  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  30.24 
 
 
394 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2708  acyl-CoA dehydrogenase type 2  22.77 
 
 
390 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5074  oxidoreductase  22.68 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207548  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5530  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.56 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.061721  decreased coverage  0.00000254455 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1413  Acyl-CoA dehydrogenase-like  24.1 
 
 
397 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.465411  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3648  acyl-CoA dehydrogenase type 2  28.51 
 
 
399 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15060  oxidoreductase  26.01 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0529359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0705  putative oxidoreductase, MmfH  24.05 
 
 
385 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000202929  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3845  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.22 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.414034  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5311  indole dioxygenase  24.47 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1828  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.66 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.463674  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1773  GTP cyclohydrolase II  27.55 
 
 
636 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000841591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4548  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.54 
 
 
393 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.277841 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2671  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.33 
 
 
390 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00505359  normal  0.0674396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4703  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.8 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2879  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3691  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3748  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.36 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1234  putative hydrolase  24.55 
 
 
370 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4709  Acyl-CoA dehydrogenase, type 2-like protein  24.47 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4795  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.47 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5094  acyl-CoA dehydrogenase type 2  24.47 
 
 
394 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.195483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1542  hypothetical protein  23.55 
 
 
413 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0941275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1536  acyl-CoA dehydrogenase type 2  26.87 
 
 
397 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.307066  hitchhiker  0.00234859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3505  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.18 
 
 
389 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0636117  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13603  oxidoreductase  23.61 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.601758 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1633  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain-containing protein  23.96 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.464804 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0920  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  21.96 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3508  Acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  23.3 
 
 
388 aa  77  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.115117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0206  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.1 
 
 
391 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4091  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.63 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4084  acyl-CoA dehydrogenase type 2 domain protein  24.15 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5779  hypothetical protein  24.66 
 
 
405 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5219  oxidoreductase  22.86 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5308  acyl-CoA dehydrogenase type 2  23.39 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0842748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1463  acyl-CoA dehydrogenase type 2  25.66 
 
 
394 aa  73.2  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>