94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2773 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  813    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  49.85 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  49.42 
 
 		 400 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  49.12 
 
 		 400 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  50.88 
 
 		 389 aa  352  7e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  49.3 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  49.42 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  50.45 
 
 		 404 aa  345  1e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  49.56 
 
 		 371 aa  341  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  50.29 
 
 		 341 aa  341  1e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  47.54 
 
 		 363 aa  341  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  51.95 
 
 		 340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  52.4 
 
 		 340 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  51.8 
 
 		 340 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  51.37 
 
 		 370 aa  334  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  51.59 
 
 		 322 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  50.58 
 
 		 340 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  51.85 
 
 		 359 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  47.08 
 
 		 356 aa  322  9.000000000000001e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  47.21 
 
 		 345 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  51.08 
 
 		 358 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  50.77 
 
 		 358 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  47.44 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  49.7 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  49.7 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  49.7 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  52.61 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  50.16 
 
 		 411 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  48.84 
 
 		 372 aa  312  5.999999999999999e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  44.19 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  46.57 
 
 		 351 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  46.57 
 
 		 356 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  44.61 
 
 		 370 aa  310  4e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  46.86 
 
 		 363 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  52.94 
 
 		 352 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  45.91 
 
 		 333 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  46.11 
 
 		 333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  48.39 
 
 		 361 aa  299  6e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  46.49 
 
 		 392 aa  298  9e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  48.54 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  49.01 
 
 		 420 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  46.17 
 
 		 415 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  43.41 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  43.27 
 
 		 379 aa  283  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  48.23 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  45.07 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  50.77 
 
 		 406 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  42.5 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  47.6 
 
 		 350 aa  271  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  37.35 
 
 		 349 aa  270  4e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  40.36 
 
 		 353 aa  263  4.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  40.95 
 
 		 375 aa  259  4e-68  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  39.23 
 
 		 361 aa  252  9.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  43.88 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  43.54 
 
 		 335 aa  242  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  44.56 
 
 		 344 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  36.5 
 
 		 360 aa  239  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  39.21 
 
 		 334 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  38.6 
 
 		 335 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  46.33 
 
 		 342 aa  236  8e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  41.44 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  43.79 
 
 		 376 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  41.46 
 
 		 331 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  39.45 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  41.4 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  38.54 
 
 		 340 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  42.29 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  41.84 
 
 		 334 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  37.54 
 
 		 336 aa  206  8e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  42.67 
 
 		 319 aa  202  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  38.72 
 
 		 323 aa  202  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  41.14 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  37.87 
 
 		 340 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  37.42 
 
 		 332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  37.94 
 
 		 349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  38.06 
 
 		 333 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  34.17 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  36.49 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  42.35 
 
 		 330 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  43.24 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  37.41 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  37.41 
 
 		 339 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  37.07 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  39.43 
 
 		 327 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  42.91 
 
 		 381 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  34.39 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  38.83 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  41.61 
 
 		 372 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  40.86 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  26.22 
 
 		 551 aa  64.3  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 780 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  23.81 
 
 		 881 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  24.82 
 
 		 871 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>