24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI03280 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  51.78 
 
 		 871 aa  755    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  100 
 
 		 881 aa  1777    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  49.38 
 
 		 780 aa  691    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  49.1 
 
 		 491 aa  368  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13384  predicted protein  43.93 
 
 		 594 aa  353  8.999999999999999e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  39.78 
 
 		 551 aa  295  3e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  24.44 
 
 		 361 aa  54.7  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  27.91 
 
 		 340 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  23.32 
 
 		 332 aa  51.2  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  23.32 
 
 		 336 aa  50.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  24.41 
 
 		 334 aa  50.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  22.17 
 
 		 338 aa  49.3  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  25.73 
 
 		 360 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  25.19 
 
 		 326 aa  48.9  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  25.7 
 
 		 327 aa  48.5  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  26.95 
 
 		 345 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  27.88 
 
 		 333 aa  48.9  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  28.32 
 
 		 340 aa  48.1  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  47.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  24.15 
 
 		 392 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  26.22 
 
 		 356 aa  46.6  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  25.13 
 
 		 363 aa  45.8  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  26.83 
 
 		 351 aa  45.8  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  25.43 
 
 		 415 aa  44.7  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>