92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1322 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  100 
 
 		 551 aa  1110    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 780 aa  294  2e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  37.77 
 
 		 491 aa  283  6.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  37.26 
 
 		 871 aa  276  5e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13384  predicted protein  34.5 
 
 		 594 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  39.78 
 
 		 881 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  24.64 
 
 		 338 aa  75.1  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  27.64 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  28 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  27.01 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  28 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  29.09 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  26.9 
 
 		 389 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  27.33 
 
 		 356 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  27.33 
 
 		 351 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  25.15 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  25.15 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  25.15 
 
 		 340 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  27.07 
 
 		 406 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  28.74 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  25.15 
 
 		 341 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  24.56 
 
 		 340 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  26.22 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  25.73 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  26.32 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  23.05 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  24.86 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  25.7 
 
 		 319 aa  63.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  27.22 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  27.22 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  27.22 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  25.15 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  22.28 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  27.88 
 
 		 370 aa  60.5  0.00000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 396 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  21.88 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  28.99 
 
 		 349 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  21.59 
 
 		 349 aa  59.3  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  21.3 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  23.81 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  27.84 
 
 		 353 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  24.63 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  24.7 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  25.45 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  25.9 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  25 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  25.75 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  25.6 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  25.54 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  27.98 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  27.38 
 
 		 334 aa  57  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  28.74 
 
 		 348 aa  57  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  29.17 
 
 		 360 aa  57  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  23.95 
 
 		 333 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  27.27 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  26.83 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  24.26 
 
 		 333 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  25.45 
 
 		 344 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  23.67 
 
 		 415 aa  56.2  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  22.46 
 
 		 381 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  22.46 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  24.74 
 
 		 327 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  26.81 
 
 		 330 aa  55.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  21.3 
 
 		 465 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  24.71 
 
 		 420 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  25.29 
 
 		 439 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  25 
 
 		 327 aa  53.5  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  23.9 
 
 		 340 aa  53.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  23.96 
 
 		 375 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  23.95 
 
 		 370 aa  53.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  21.71 
 
 		 326 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  21.35 
 
 		 350 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  20.97 
 
 		 336 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  25.9 
 
 		 342 aa  52  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  22.41 
 
 		 331 aa  50.4  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  20.63 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  23.33 
 
 		 334 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  25.79 
 
 		 361 aa  49.3  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  22.13 
 
 		 336 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  20.8 
 
 		 340 aa  47.4  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  23.16 
 
 		 316 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  25.84 
 
 		 366 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  20.69 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  20.69 
 
 		 339 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  20.69 
 
 		 339 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  24.86 
 
 		 361 aa  45.1  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  25.12 
 
 		 352 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  20.34 
 
 		 340 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  20.9 
 
 		 323 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  23.67 
 
 		 395 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>