93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1709 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  100 
 
 
376 aa  718    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  72.37 
 
 
381 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  72.37 
 
 
377 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  72.37 
 
 
372 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  45.91 
 
 
401 aa  270  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  44.07 
 
 
400 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  43.77 
 
 
400 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  42.86 
 
 
363 aa  264  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  43.13 
 
 
404 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  46.13 
 
 
371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  46.15 
 
 
389 aa  253  3e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  42.94 
 
 
396 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  46.67 
 
 
372 aa  245  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  45.24 
 
 
336 aa  239  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  44.16 
 
 
349 aa  238  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  44.01 
 
 
333 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  42.7 
 
 
382 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  42.22 
 
 
366 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  43.22 
 
 
340 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  44.67 
 
 
411 aa  229  8e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  46.67 
 
 
342 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  46.67 
 
 
342 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  42.09 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  46.67 
 
 
342 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  41.75 
 
 
351 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  41.36 
 
 
340 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  45.26 
 
 
359 aa  224  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  41.4 
 
 
356 aa  223  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  45.23 
 
 
358 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  44.88 
 
 
358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  41.43 
 
 
365 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  41.07 
 
 
340 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  43.79 
 
 
397 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  43 
 
 
439 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  39.16 
 
 
370 aa  219  5e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  43.36 
 
 
322 aa  219  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  43.06 
 
 
345 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  42.96 
 
 
420 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  43.11 
 
 
341 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  43.94 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  45.42 
 
 
363 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  45.58 
 
 
392 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  39.88 
 
 
361 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  38.18 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  45.52 
 
 
352 aa  213  3.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  33.75 
 
 
348 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  39.8 
 
 
337 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  41.34 
 
 
333 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  37.54 
 
 
375 aa  208  1e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  44.07 
 
 
415 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  35.22 
 
 
353 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  38.41 
 
 
379 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  40.96 
 
 
370 aa  205  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  45.67 
 
 
342 aa  204  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  40.99 
 
 
356 aa  204  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  38.25 
 
 
366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  44.41 
 
 
406 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  40.28 
 
 
333 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  39.22 
 
 
332 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  33.1 
 
 
360 aa  197  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  36.14 
 
 
327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  42.59 
 
 
327 aa  196  8.000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  40.14 
 
 
350 aa  192  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  39.59 
 
 
340 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  40.28 
 
 
340 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  43.48 
 
 
344 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  40.79 
 
 
335 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  41.97 
 
 
417 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  42.39 
 
 
344 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  31.23 
 
 
361 aa  186  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  42.03 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  38.36 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  38.05 
 
 
336 aa  182  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  41.57 
 
 
327 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  35.26 
 
 
465 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  39.37 
 
 
334 aa  178  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  38.46 
 
 
339 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  38.11 
 
 
339 aa  176  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  41.52 
 
 
340 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  41.4 
 
 
316 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  36.62 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  35.99 
 
 
395 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  34.95 
 
 
323 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  31.56 
 
 
340 aa  160  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  35.36 
 
 
372 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  38.85 
 
 
326 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  41.32 
 
 
326 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  38.78 
 
 
330 aa  145  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  34.34 
 
 
319 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  21.88 
 
 
551 aa  60.1  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  22.34 
 
 
491 aa  47  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  23.75 
 
 
780 aa  46.6  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>