94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7273 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  100 
 
 		 322 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  51.59 
 
 		 397 aa  334  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  48.06 
 
 		 400 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  49.16 
 
 		 401 aa  301  9e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  48.06 
 
 		 400 aa  301  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 371 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  48.82 
 
 		 363 aa  295  7e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  47.74 
 
 		 370 aa  288  9e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  50 
 
 		 389 aa  288  1e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  48.65 
 
 		 404 aa  285  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  46.5 
 
 		 345 aa  276  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  49.13 
 
 		 359 aa  275  5e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  44.16 
 
 		 366 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  45.4 
 
 		 370 aa  275  7e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  49.65 
 
 		 342 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  49.65 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  49.65 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  45.95 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  45.63 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  47.35 
 
 		 396 aa  272  5.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  44.94 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  42.9 
 
 		 340 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  43.23 
 
 		 340 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  48.76 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  49.11 
 
 		 392 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  42.9 
 
 		 340 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  48.24 
 
 		 358 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  47.2 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  42.9 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  45.63 
 
 		 372 aa  267  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  44.44 
 
 		 361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  48.24 
 
 		 358 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  45.81 
 
 		 363 aa  265  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  46.62 
 
 		 341 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  45.07 
 
 		 351 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  44.37 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  47.83 
 
 		 350 aa  262  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  45.39 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  46.26 
 
 		 352 aa  257  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  44.72 
 
 		 420 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  40.26 
 
 		 365 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  42.81 
 
 		 366 aa  252  7e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  39.65 
 
 		 360 aa  251  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  45.8 
 
 		 382 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  46.26 
 
 		 406 aa  246  3e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  37.97 
 
 		 349 aa  244  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  40.74 
 
 		 348 aa  243  5e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  45.82 
 
 		 417 aa  239  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  45.42 
 
 		 415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  42.11 
 
 		 465 aa  232  8.000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  39.37 
 
 		 353 aa  228  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  38.25 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  43.36 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  42.4 
 
 		 349 aa  219  7e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  39.35 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  39.18 
 
 		 344 aa  209  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  38.99 
 
 		 335 aa  207  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  39.93 
 
 		 333 aa  206  3e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  37.92 
 
 		 379 aa  206  5e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  37.21 
 
 		 375 aa  205  8e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  40.5 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  41.05 
 
 		 338 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  37.77 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  37.89 
 
 		 340 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  37.77 
 
 		 335 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  33.76 
 
 		 327 aa  193  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  35.79 
 
 		 340 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  38.16 
 
 		 395 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  43.62 
 
 		 377 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  35.87 
 
 		 372 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  42.96 
 
 		 381 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  36.28 
 
 		 332 aa  188  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  37.1 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  38.03 
 
 		 336 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  37.1 
 
 		 339 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  37.1 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  40.35 
 
 		 342 aa  182  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  36.79 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  37.5 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  39.01 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  34.53 
 
 		 340 aa  178  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  39.5 
 
 		 340 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  43.46 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  38.52 
 
 		 337 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  39.08 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  37.72 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  37.63 
 
 		 316 aa  162  8.000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  37.8 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  36.43 
 
 		 319 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  34.12 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  21.3 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  21.65 
 
 		 871 aa  44.3  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  26.88 
 
 		 881 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0747  integrase family protein  24.5 
 
 		 420 aa  42.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0631504 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>