94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0728 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  666    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  46.02 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  49.41 
 
 		 340 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  50.89 
 
 		 330 aa  285  9e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  48.63 
 
 		 331 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  48.24 
 
 		 336 aa  276  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  47.63 
 
 		 340 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  48.37 
 
 		 332 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  46.11 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  45.81 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  45.81 
 
 		 339 aa  267  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  47.18 
 
 		 338 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  50.3 
 
 		 327 aa  261  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  46.53 
 
 		 342 aa  252  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  50.6 
 
 		 327 aa  252  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  43.44 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  50.3 
 
 		 326 aa  248  1e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  47.42 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  40.3 
 
 		 379 aa  239  5e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  45.42 
 
 		 359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  43.42 
 
 		 411 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  42.72 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  44.84 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  40.25 
 
 		 363 aa  233  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  44.12 
 
 		 358 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  44.12 
 
 		 358 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  41.72 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  40.65 
 
 		 370 aa  230  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  44.23 
 
 		 389 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  43.13 
 
 		 342 aa  228  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  42 
 
 		 401 aa  228  8e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  43.13 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  43.13 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  41.67 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  42.11 
 
 		 400 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  43.53 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  44.3 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  41.69 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  38.33 
 
 		 353 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  40.3 
 
 		 361 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  43.34 
 
 		 371 aa  214  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  41.84 
 
 		 397 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  41.72 
 
 		 382 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  39.33 
 
 		 365 aa  213  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  41.64 
 
 		 363 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  35.96 
 
 		 349 aa  209  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  40.13 
 
 		 341 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  44.44 
 
 		 352 aa  208  9e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  42.14 
 
 		 392 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  39.34 
 
 		 366 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  44.37 
 
 		 415 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  40.6 
 
 		 351 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  39.81 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  40.72 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  39.81 
 
 		 340 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  39.93 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  39.81 
 
 		 340 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  38.26 
 
 		 333 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  39.56 
 
 		 356 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  39.26 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  40.43 
 
 		 465 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  39.81 
 
 		 375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  41.58 
 
 		 406 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  39.06 
 
 		 345 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  38.41 
 
 		 333 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  41.16 
 
 		 350 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  40.98 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  43.03 
 
 		 377 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  39.37 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  33.12 
 
 		 348 aa  186  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  43.33 
 
 		 372 aa  185  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  42.73 
 
 		 381 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  43.84 
 
 		 316 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  39.08 
 
 		 322 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  35.42 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  35.21 
 
 		 360 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  37.62 
 
 		 344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  38.19 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  37.27 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  35.22 
 
 		 370 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  38.83 
 
 		 344 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  35.14 
 
 		 334 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  35.02 
 
 		 335 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  32.61 
 
 		 340 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  32.72 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  39.32 
 
 		 319 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  36.27 
 
 		 349 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  37.11 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  36.18 
 
 		 372 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  35.47 
 
 		 395 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  25.84 
 
 		 871 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  24.41 
 
 		 881 aa  52.8  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  22.99 
 
 		 551 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  21.34 
 
 		 491 aa  49.7  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>