23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_46944 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  48.06 
 
 		 881 aa  669    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00253  Topoisomerase I [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q875K2]  51.95 
 
 		 871 aa  753    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.698045 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46944  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 780 aa  1602    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.000227493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17621  predicted protein  48.37 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0110477  decreased coverage  0.0000723215 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13384  predicted protein  43.49 
 
 		 594 aa  365  2e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  38.46 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  28.9 
 
 		 338 aa  54.7  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  26.5 
 
 		 358 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  26.37 
 
 		 358 aa  53.9  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  26.32 
 
 		 397 aa  51.2  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  26.83 
 
 		 345 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  29.89 
 
 		 340 aa  47.8  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  28.29 
 
 		 392 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  27.63 
 
 		 363 aa  47  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  24.26 
 
 		 356 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  24.71 
 
 		 342 aa  46.6  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  30.85 
 
 		 340 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  23.75 
 
 		 376 aa  47  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  25.16 
 
 		 411 aa  45.8  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  28.46 
 
 		 465 aa  45.8  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  23.49 
 
 		 370 aa  45.8  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  23.98 
 
 		 333 aa  45.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  23.53 
 
 		 351 aa  44.3  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>