92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2791 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_2791  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  668    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0179136 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3091  hypothetical protein  82.78 
 
 
336 aa  564  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1645  putative topoisomerase IB  52.66 
 
 
326 aa  297  2e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0910813  normal  0.088661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24670  topoisomerase IB  46.75 
 
 
331 aa  269  5e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112949  normal  0.189574 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6633  hypothetical protein  46.38 
 
 
337 aa  266  2.9999999999999995e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.13084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2115  DNA topoisomerase  49.84 
 
 
338 aa  264  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0728  hypothetical protein  48.37 
 
 
334 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1308  hypothetical protein  46.73 
 
 
339 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1296  hypothetical protein  46.41 
 
 
339 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.300668  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1279  hypothetical protein  46.41 
 
 
339 aa  255  8e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220078  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1753  hypothetical protein  46.63 
 
 
327 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3430  DNA topoisomerase  47.51 
 
 
342 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3998  putative DNA topoisomerase I  39.87 
 
 
363 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4748  hypothetical protein  44.77 
 
 
340 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1357  putative viral-like DNA topoisomerase  47.62 
 
 
330 aa  238  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.180216  hitchhiker  0.0000165561 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1967  hypothetical protein  44.63 
 
 
340 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0761805  normal  0.132479 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1767  hypothetical protein  49.01 
 
 
327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1929  putative DNA topoisomerase I  41.08 
 
 
401 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0245783 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1732  DNA topoisomerase  40.13 
 
 
366 aa  230  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.754109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1974  putative DNA topoisomerase I  41.51 
 
 
400 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169196  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2251  putative DNA topoisomerase I  41.69 
 
 
400 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5045  putative DNA topoisomerase I  41.74 
 
 
389 aa  230  3e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110319  hitchhiker  0.00920421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0757  putative DNA topoisomerase I  42.76 
 
 
404 aa  228  1e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.864738 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5352  putative DNA topoisomerase I  40.19 
 
 
396 aa  225  6e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.438245  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5285  putative DNA topoisomerase I  41.06 
 
 
371 aa  224  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.313661  normal  0.942542 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0558  DNA topoisomerase, type I, putative  38.84 
 
 
370 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.807051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0066  hypothetical protein  42.95 
 
 
352 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3640  DNA topoisomerase, type I, putative  40.61 
 
 
336 aa  217  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.169892  normal  0.477069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4373  hypothetical protein  41.39 
 
 
372 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.372426  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1096  putative viral-like DNA topoisomerase  46.01 
 
 
326 aa  210  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0864  topoisomerase IB-like protein  35.26 
 
 
379 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.990941  hitchhiker  0.00000103848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1222  DNA topoisomerase  38.17 
 
 
349 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0995  DNA topoisomerase  35.62 
 
 
353 aa  208  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5996  DNA topoisomerase, type I, putative  40.47 
 
 
342 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.963911  normal  0.289905 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5631  DNA topoisomerase, type I, putative  40.47 
 
 
342 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.646844  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5297  DNA topoisomerase  39 
 
 
411 aa  206  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.696955  normal  0.0424045 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6487  DNA topoisomerase  40.47 
 
 
342 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4790  DNA topoisomerase IB  44.74 
 
 
316 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2759  DNA topoisomerase I  40.21 
 
 
356 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1140  putative DNA topoisomerase I  38.57 
 
 
382 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0039  hypothetical protein  39 
 
 
361 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.204308  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1320  putative DNA topoisomerase, type I  42.66 
 
 
415 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.310759  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2976  DNA topoisomerase, type I, putative  40.29 
 
 
351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0896688  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6192  DNA topoisomerase, type I, putative  39.2 
 
 
358 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2594  hypothetical protein  41.69 
 
 
350 aa  199  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2775  DNA topoisomerase  41.03 
 
 
341 aa  198  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430877  normal  0.381387 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5923  DNA topoisomerase  38.87 
 
 
358 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.813187 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2773  hypothetical protein  37.42 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1709  type I topoisomerase  39.49 
 
 
376 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.732061  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2944  DNA topoisomerase, type I, putative  40.21 
 
 
345 aa  195  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1492  putative DNA topoisomerase, type I  41.14 
 
 
406 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.236582  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3748  DNA topoisomerase  39.33 
 
 
363 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3231  DNA topoisomerase  35.47 
 
 
365 aa  192  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245073  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1162  putative DNA topoisomerase, type I  35.79 
 
 
420 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.554251 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3200  DNA topoisomerase  38.57 
 
 
340 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3425  DNA topoisomerase  39 
 
 
392 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5444  DNA topoisomerase  35.79 
 
 
439 aa  192  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.585007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35570  hypothetical protein  38.7 
 
 
333 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000834616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4311  DNA topoisomerase  40.33 
 
 
340 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2998  hypothetical protein  38.7 
 
 
333 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2291  DNA topoisomerase IB  35.74 
 
 
348 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0533881  normal  0.067771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3546  DNA topoisomerase  38.57 
 
 
340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0497199 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1939  DNA topoisomerase  38.57 
 
 
340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.915147 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3831  DNA topoisomerase  38.93 
 
 
340 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5964  DNA topoisomerase  37.25 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0366811 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7273  DNA topoisomerase  36.28 
 
 
322 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3186  DNA topoisomerase, type I, putative  33.54 
 
 
366 aa  185  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5876  putative DNA topoisomerase I protein  38.03 
 
 
334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6784  putative DNA topoisomerase I protein  36.11 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0837  DNA topoisomerase, type I, putative  32.68 
 
 
375 aa  184  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03321  DNA topoisomerase  41.55 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0745  hypothetical protein  37.8 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4313  hypothetical protein  36.99 
 
 
370 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0334  hypothetical protein  36.81 
 
 
395 aa  178  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.892369  normal  0.045652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4343  putative DNA topoisomerase, type I  34.42 
 
 
465 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.466096  normal  0.0120507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4410  putative DNA topoisomerase I protein  38.19 
 
 
372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.017671  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3368  topoisomerase IB-like protein  30.39 
 
 
360 aa  174  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01676  DNA topoisomerase  34.01 
 
 
340 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3038  type I topoisomerase  42.75 
 
 
377 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3146  type I topoisomerase  42.75 
 
 
381 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.139598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5208  type I topoisomerase  35.71 
 
 
333 aa  168  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2951  type I topoisomerase  42.69 
 
 
372 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27332  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09733  putative DNA topoisomerase I  35.52 
 
 
361 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.309621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2605  putative DNA topoisomerase I protein  38.11 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2853  hypothetical protein  32.76 
 
 
327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.866388  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0946  putative DNA topoisomerase I protein  38.11 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2968  topoisomerase IB-like protein  38.54 
 
 
344 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.171665 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0278  putative DNA topoisomerase I protein  36.14 
 
 
323 aa  158  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.402986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2946  topoisomerase IB-like protein  39.53 
 
 
319 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.361669  normal  0.0194958 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2058  type I topoisomerase, putative  35.34 
 
 
349 aa  149  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.419584  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03280  topoisomerase I  23.32 
 
 
881 aa  51.6  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1322  2-alkenal reductase  20.63 
 
 
551 aa  50.1  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000024346 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>