More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5632 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  65.41 
 
 
268 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  66.79 
 
 
268 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  66.79 
 
 
268 aa  293  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  54.65 
 
 
274 aa  259  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  53.64 
 
 
277 aa  239  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  52.24 
 
 
268 aa  231  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  55.43 
 
 
276 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  55.43 
 
 
276 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  50.56 
 
 
268 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  51.87 
 
 
268 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  50.93 
 
 
267 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  47.27 
 
 
258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  61.94 
 
 
170 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  61.94 
 
 
170 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  61.94 
 
 
170 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  58.06 
 
 
173 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  38.66 
 
 
272 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  59.86 
 
 
173 aa  176  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  60.94 
 
 
128 aa  149  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  51.97 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  56.46 
 
 
247 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  52.17 
 
 
144 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  55.33 
 
 
204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  50.64 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  50.64 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  50.64 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  52.32 
 
 
296 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  54.4 
 
 
140 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.6 
 
 
281 aa  128  8.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  50.99 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.34 
 
 
281 aa  125  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.34 
 
 
281 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  58.41 
 
 
112 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.34 
 
 
281 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  30.5 
 
 
291 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  48.33 
 
 
123 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  30.5 
 
 
283 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  30.5 
 
 
283 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  30.31 
 
 
280 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  48.65 
 
 
134 aa  105  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  52.46 
 
 
136 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  30.85 
 
 
303 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  30.85 
 
 
303 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  30.85 
 
 
303 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
252 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.21 
 
 
252 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  48 
 
 
179 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.59 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  30.94 
 
 
260 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.59 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  48.65 
 
 
139 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.71 
 
 
147 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
136 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
136 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.32 
 
 
136 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  37.41 
 
 
207 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  47.71 
 
 
147 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  31.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  31.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  31.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  31.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  31.11 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1385  hypothetical protein  67.44 
 
 
106 aa  94  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  45.79 
 
 
141 aa  92.8  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  30.19 
 
 
255 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  30.69 
 
 
294 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  32.2 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  32.2 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>