More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3527 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  528  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  99.25 
 
 		 267 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  92.91 
 
 		 268 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  92.54 
 
 		 268 aa  447  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  55.04 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  51.32 
 
 		 268 aa  248  9e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  49.43 
 
 		 274 aa  228  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  50.56 
 
 		 268 aa  224  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  48.7 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  48.7 
 
 		 268 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  47.74 
 
 		 277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  49.81 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  49.81 
 
 		 276 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  61.18 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  60.53 
 
 		 247 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  59.21 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  59.21 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  59.21 
 
 		 262 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  62.84 
 
 		 204 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  53.02 
 
 		 170 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  53.02 
 
 		 170 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  53.02 
 
 		 170 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  52.35 
 
 		 173 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  52.35 
 
 		 173 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  63.93 
 
 		 136 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  33.59 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  57.5 
 
 		 123 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  55.2 
 
 		 147 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  46.48 
 
 		 144 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  52.76 
 
 		 128 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  52.63 
 
 		 296 aa  129  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.24 
 
 		 147 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  51.97 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  34.24 
 
 		 280 aa  122  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  32.57 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  32.57 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  32.57 
 
 		 283 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.38 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  51.69 
 
 		 140 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.74 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  45.45 
 
 		 212 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.1 
 
 		 281 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.38 
 
 		 281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  49.19 
 
 		 179 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  56.44 
 
 		 112 aa  109  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.09 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  31.54 
 
 		 260 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  31.54 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  31.54 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  31.54 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  43.44 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  43.44 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  43.44 
 
 		 136 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  34.38 
 
 		 244 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  46.67 
 
 		 134 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.33 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.33 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.33 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  33.58 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  33.58 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  40.74 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  75.81 
 
 		 114 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  33.08 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  33.08 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  31.95 
 
 		 260 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.61 
 
 		 141 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  37.5 
 
 		 146 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.73 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.73 
 
 		 252 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>