93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2524 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  100 
 
 
112 aa  221  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 
140 aa  213  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
170 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
170 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  82.14 
 
 
170 aa  193  7e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  80.36 
 
 
173 aa  188  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  79.44 
 
 
173 aa  176  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  74.11 
 
 
128 aa  169  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  62.16 
 
 
268 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  61.36 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  61.36 
 
 
268 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  52.58 
 
 
144 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  62.63 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  54.13 
 
 
274 aa  97.4  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  61.36 
 
 
268 aa  94  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  56.57 
 
 
247 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  55.56 
 
 
262 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  55.56 
 
 
262 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  55.56 
 
 
262 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  57.58 
 
 
204 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  54.88 
 
 
268 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  54.88 
 
 
268 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  53.66 
 
 
268 aa  87.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  52.44 
 
 
267 aa  87  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  44.23 
 
 
209 aa  86.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  42.31 
 
 
123 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  54.37 
 
 
296 aa  84.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  52.94 
 
 
277 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  48.6 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  48.6 
 
 
276 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  51.46 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  39.6 
 
 
258 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  44.19 
 
 
280 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  39.64 
 
 
291 aa  70.5  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  39.64 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  39.64 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  44.79 
 
 
179 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  51.52 
 
 
160 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  43.53 
 
 
129 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  37.5 
 
 
212 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  42.68 
 
 
272 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  34.07 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  34.07 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2024  putative transposase  50 
 
 
70 aa  52  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04737  hypothetical protein  39.22 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06072  hypothetical protein  40 
 
 
57 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  35.59 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  52.46 
 
 
182 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  37.63 
 
 
232 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  30.63 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  30.63 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  32.65 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  32.65 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  34.95 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  28.57 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  34.95 
 
 
252 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  34.95 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  43.33 
 
 
124 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  43.33 
 
 
124 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  28 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  43.33 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  30.28 
 
 
260 aa  40.8  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>