97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1734 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  100 
 
 		 140 aa  283  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  93.75 
 
 		 112 aa  213  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  78.4 
 
 		 170 aa  207  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  78.4 
 
 		 170 aa  207  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  78.4 
 
 		 170 aa  207  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  76.8 
 
 		 173 aa  203  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  75.83 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  70.97 
 
 		 128 aa  183  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  58.68 
 
 		 268 aa  137  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  51.22 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  51.22 
 
 		 268 aa  111  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  53.72 
 
 		 274 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  55.65 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  44.83 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  51.3 
 
 		 247 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  49.57 
 
 		 262 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  49.57 
 
 		 262 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  49.57 
 
 		 262 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  47.54 
 
 		 277 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  49.58 
 
 		 276 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  49.58 
 
 		 276 aa  94.4  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  43.1 
 
 		 209 aa  94.4  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  49.6 
 
 		 268 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  50.85 
 
 		 267 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  51.69 
 
 		 268 aa  92  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  51.69 
 
 		 268 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  51.69 
 
 		 268 aa  92  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  50.43 
 
 		 204 aa  90.9  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  49.57 
 
 		 296 aa  89.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  39.47 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  47.01 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  38.94 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  38.58 
 
 		 280 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  40.83 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  40.83 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  40.83 
 
 		 283 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  39.82 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  37.01 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  34.43 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  45.45 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  33.6 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  44.33 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  28.93 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  28.1 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  33.08 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  38.82 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  29.77 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  29.77 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2513  putative transposase  47.76 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2024  putative transposase  42 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  27.78 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  37.5 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  25 
 
 		 146 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  27.62 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01990  putative Transposase, IS4  48 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06540  putative Transposase IS4  48 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.231609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  34.38 
 
 		 294 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  33.33 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  33.33 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  33.33 
 
 		 303 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3162  hypothetical protein  41.77 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04737  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3841  transposase IS4 family protein  29.17 
 
 		 167 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>