More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5581 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  66.91 
 
 
268 aa  344  8e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  66.79 
 
 
268 aa  292  4e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  51.15 
 
 
274 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  48.65 
 
 
258 aa  248  9e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  51.54 
 
 
277 aa  237  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  49.44 
 
 
268 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  49.07 
 
 
268 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  52.14 
 
 
276 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  52.14 
 
 
276 aa  232  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  49.44 
 
 
268 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  48.7 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 
170 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 
170 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  57.69 
 
 
170 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  56.41 
 
 
173 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  58.5 
 
 
173 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  37.31 
 
 
272 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  55.84 
 
 
247 aa  155  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  53.9 
 
 
262 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  53.9 
 
 
262 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  53.9 
 
 
262 aa  149  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  55.84 
 
 
204 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  47.74 
 
 
209 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  50.69 
 
 
144 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  55.08 
 
 
134 aa  137  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  50.32 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  55.28 
 
 
140 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  56.14 
 
 
139 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  53.12 
 
 
128 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  49.03 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  60.55 
 
 
112 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  55.36 
 
 
147 aa  126  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  51.3 
 
 
141 aa  125  7e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  54.31 
 
 
147 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  32.1 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  49.57 
 
 
136 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  49.57 
 
 
136 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  49.57 
 
 
136 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  31.6 
 
 
291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  31.6 
 
 
283 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  31.6 
 
 
283 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.1 
 
 
281 aa  119  6e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.16 
 
 
281 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.45 
 
 
281 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  47.83 
 
 
141 aa  115  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.45 
 
 
281 aa  115  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  53.54 
 
 
136 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  45 
 
 
123 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  32.32 
 
 
303 aa  105  8e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  32.32 
 
 
303 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  32.32 
 
 
303 aa  105  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  32.1 
 
 
260 aa  99.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  36.91 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  31.95 
 
 
255 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  29.92 
 
 
260 aa  94.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  29.92 
 
 
260 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  34.14 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  29.92 
 
 
260 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  29.92 
 
 
260 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  30.92 
 
 
259 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.26 
 
 
251 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  35.42 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  32.58 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  28.02 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  28.02 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1749  transposase IS5 family protein  31.97 
 
 
274 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126196  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  28.02 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  32.82 
 
 
265 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>