More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4457 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  100 
 
 
209 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  85.35 
 
 
258 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  58.25 
 
 
262 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  58.25 
 
 
262 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  58.25 
 
 
262 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  56.5 
 
 
247 aa  216  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 
123 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  58.59 
 
 
204 aa  201  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  61.18 
 
 
268 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  60.93 
 
 
268 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  60.39 
 
 
268 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  60.13 
 
 
267 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  47.44 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  47.44 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  47.44 
 
 
170 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  61.9 
 
 
136 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  46.58 
 
 
173 aa  148  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  46.79 
 
 
173 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  49.33 
 
 
274 aa  135  4e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  46.5 
 
 
268 aa  134  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  44.52 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  44.52 
 
 
268 aa  128  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  44.59 
 
 
277 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  43.83 
 
 
276 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  43.83 
 
 
276 aa  124  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  48.68 
 
 
268 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  46.1 
 
 
144 aa  120  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  40.31 
 
 
296 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  47.5 
 
 
128 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  40.51 
 
 
216 aa  112  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  43.55 
 
 
179 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  44.35 
 
 
212 aa  99  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  43.1 
 
 
140 aa  94.4  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  37.75 
 
 
272 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  44.23 
 
 
112 aa  86.7  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  32.65 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  32.65 
 
 
283 aa  80.1  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  35.57 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  37.96 
 
 
145 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  32.59 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  32.85 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  32.85 
 
 
145 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  30.22 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  32.35 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  32.35 
 
 
133 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  31.62 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1107  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665048  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  33.55 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4159  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  33.55 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6136  transposase IS4 family protein  38.57 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  33.55 
 
 
303 aa  68.6  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4215  transposase, IS4  30.22 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1042  transposase, IS4  32.72 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.241795  normal  0.0215531 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1699  transposase, IS4  32.72 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0430056  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2208  transposase, IS4  32.72 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2276  transposase, IS4  32.72 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00100946  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  29.2 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0282  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.823794 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0280  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03511  transposase and inactivated derivatives  36.67 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1472  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.592083  hitchhiker  0.0000000061628 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4189  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0203984  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0839  transposase IS4 family protein  31.51 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0489  putative transposase IS4  30.14 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891999  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0091  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0399  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1399  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.878322  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1799  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.087482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2530  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2707  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  34.56 
 
 
270 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>