130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3860 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  100 
 
 
291 aa  597  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  98.23 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  98.23 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  62.41 
 
 
280 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  34.34 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  56.73 
 
 
129 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  29.12 
 
 
272 aa  120  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  32.18 
 
 
268 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  31.8 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  31.8 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  32.18 
 
 
268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  31.42 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  31.42 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  38.85 
 
 
173 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  39.22 
 
 
173 aa  102  9e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  38.71 
 
 
170 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  38.71 
 
 
170 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  38.71 
 
 
170 aa  101  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  31.11 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  29.81 
 
 
274 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  29.5 
 
 
258 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  30.93 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  30.93 
 
 
276 aa  97.8  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  29.44 
 
 
268 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  33.33 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  40.83 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  33.83 
 
 
207 aa  79  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  35.83 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  35.83 
 
 
163 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  34.48 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  34.48 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  34.48 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  35.86 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  35.94 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  33.56 
 
 
144 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  39.64 
 
 
112 aa  70.5  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  31.21 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  33.33 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  33.33 
 
 
296 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  32 
 
 
204 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  58.5  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  29.51 
 
 
128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  57.4  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  29.51 
 
 
117 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  29.51 
 
 
116 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  30.71 
 
 
140 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  30.71 
 
 
140 aa  52.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  31.37 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  31.37 
 
 
163 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  25.83 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3208  transposase, IS4 family protein  30.07 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.569124  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  23.39 
 
 
281 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3140  transposase, IS4 family protein  30.94 
 
 
268 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3075  transposase, IS4  25.91 
 
 
270 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 
136 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2925  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  25.83 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1324  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.751999  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2053  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00218403  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2394  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0935306  normal  0.614903 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3910  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1893  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0011  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.685381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5116  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4896  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.9339 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5371  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.167479 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0413  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0605  transposase IS4 family protein  28.4 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>