144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0582 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  100 
 
 		 128 aa  260  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  68.75 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  68.75 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  68.75 
 
 		 170 aa  192  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  66.41 
 
 		 173 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  70.97 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  65.85 
 
 		 173 aa  179  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  74.11 
 
 		 112 aa  169  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  57.36 
 
 		 268 aa  140  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  50 
 
 		 144 aa  120  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  56.25 
 
 		 268 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  47.5 
 
 		 209 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  48.44 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  48.44 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  54.33 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  54.33 
 
 		 268 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  54.17 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  51.2 
 
 		 274 aa  110  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  52.76 
 
 		 268 aa  110  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  51.97 
 
 		 267 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  54.17 
 
 		 204 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  50.83 
 
 		 247 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  50 
 
 		 262 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  50 
 
 		 262 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  50 
 
 		 262 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  45.3 
 
 		 258 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  46.03 
 
 		 277 aa  104  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  50 
 
 		 296 aa  100  6e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  47.97 
 
 		 276 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  47.97 
 
 		 276 aa  100  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  43.86 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  47.5 
 
 		 216 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  41.22 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  47.41 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  41.58 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  37.5 
 
 		 280 aa  74.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  35.94 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  35.94 
 
 		 283 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  35.94 
 
 		 283 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1877  transposase, IS4  48.48 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06084  hypothetical protein  32.8 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01099  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02156  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02820  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02895  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05084  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05841  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05895  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05987  hypothetical protein  32 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1328  transposase, IS4 family protein  32.59 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1740  transposase, IS4 family protein  32.59 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2347  transposase IS4 family protein  29.01 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4328  ISPs1, transposase OrfB  28.79 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4722  IS4 family transposase  32.59 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4817  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.943177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4825  transposase IS4 family protein  28.79 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  40 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2024  putative transposase  46 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.887373 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  54.7  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  33.58 
 
 		 303 aa  54.3  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2506  IS4 family transposase  35.34 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3162  hypothetical protein  46.91 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.290127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04737  hypothetical protein  32.5 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2877  hypothetical protein  48.21 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.500352  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.6 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06072  hypothetical protein  40.82 
 
 		 57 aa  50.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.6 
 
 		 281 aa  50.8  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.68 
 
 		 281 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1979  transposase IS4 family protein  37.97 
 
 		 304 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23120  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06560  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.180916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14930  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0216395  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15000  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.09593  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14820  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0399604  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14750  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.337332  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21800  putative Transposase, IS4 family  42.65 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.20472  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4463  transposase IS4 family protein  29.1 
 
 		 188 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3634  transposase  43.94 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0427337 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1745  transposase  43.94 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7817  transposase  33.33 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  27.48 
 
 		 260 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>