More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6398 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  85.35 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  245  4e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  55.04 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  55.43 
 
 		 267 aa  241  9e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  49.22 
 
 		 268 aa  234  8e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  47.27 
 
 		 274 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  85.59 
 
 		 147 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  44.06 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  47.49 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  47.49 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  45.1 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  45.1 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  81.08 
 
 		 123 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  46.48 
 
 		 268 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  62.5 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  62.5 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  62.5 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  59.44 
 
 		 247 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  59.57 
 
 		 204 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  56.69 
 
 		 147 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  32.3 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  45.14 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  45.14 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  45.14 
 
 		 170 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5739  transposase IS4 family protein  60.17 
 
 		 136 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  44.44 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.62 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.62 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.62 
 
 		 136 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.65 
 
 		 141 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  43.28 
 
 		 144 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  46.36 
 
 		 134 aa  105  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  45.3 
 
 		 128 aa  105  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  42.11 
 
 		 139 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  40.91 
 
 		 141 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  29.5 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1059  hypothetical protein  36.69 
 
 		 207 aa  98.6  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  29.12 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  29.12 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  29.48 
 
 		 255 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  31.87 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3504  transposase, IS4 family protein  41.94 
 
 		 179 aa  96.3  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  30.14 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  30.14 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  30.14 
 
 		 303 aa  95.9  6e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0555  ISJP4 transposase  41.13 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0733483  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  44.44 
 
 		 296 aa  93.2  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  30.12 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  32.02 
 
 		 295 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  43.92 
 
 		 216 aa  89.4  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.92 
 
 		 281 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  37.31 
 
 		 163 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  37.31 
 
 		 163 aa  87.4  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  27.24 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.06 
 
 		 281 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.06 
 
 		 281 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  26.64 
 
 		 260 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  29 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  27.31 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2598  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0651195 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  27.31 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0007  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00000000381041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4011  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000062749  hitchhiker  0.0000247291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5329  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0475309 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  27.31 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4446  transposase IS4 family protein  26.27 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2423  transposase, IS4 family protein  28.69 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2939  transposase, IS4 family protein  28.69 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.393582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3263  transposase, IS4 family protein  28.69 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3765  transposase, IS4 family protein  28.69 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4617  transposase, IS4 family protein  28.69 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>