More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4945 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007949  Bpro_4945  transposase  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  56.33 
 
 
175 aa  186  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3240  transposase  52.23 
 
 
163 aa  159  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  44.76 
 
 
272 aa  143  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  39.84 
 
 
163 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  39.84 
 
 
163 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  37.12 
 
 
128 aa  95.5  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  38.46 
 
 
116 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  37.61 
 
 
117 aa  92  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  37.31 
 
 
258 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  35.92 
 
 
109 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  33.76 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  33.76 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  35.82 
 
 
277 aa  77.8  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  32.84 
 
 
274 aa  73.9  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  34.43 
 
 
134 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  34.09 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  36.89 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  31.34 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.06 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.61 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.61 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  32.61 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0773  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1562  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2732  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2909  ISSod6 transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3272  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3478  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0074  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0426639  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0097  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0162  ISSod6, transposase  32.21 
 
 
252 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.760495  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  33.33 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  33.86 
 
 
280 aa  63.9  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  31.67 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  31.67 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  31.67 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3439  IS1647-like transposase  35.71 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  29.6 
 
 
147 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3937  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.67 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  hitchhiker  0.00837817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0775  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.67 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3270  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.67 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4622  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.67 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4780  transposase and inactivated derivatives-like protein  31.67 
 
 
181 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835034  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  46.43 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  29.23 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.08 
 
 
281 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.19 
 
 
281 aa  57.4  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  34.15 
 
 
303 aa  57  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  32.74 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  34.78 
 
 
150 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  30.85 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  32.74 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.19 
 
 
281 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  32.74 
 
 
129 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  32.74 
 
 
135 aa  57  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  30.88 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  30.88 
 
 
123 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  31.91 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  30.7 
 
 
141 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30 
 
 
281 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.58 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>