More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3088 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  251  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  95.8 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  93.64 
 
 		 139 aa  220  4e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  62.18 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  62.18 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0516  hypothetical protein  59.34 
 
 		 104 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.142915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  32.11 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  32.11 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  32.11 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.91 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  37.93 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  32.2 
 
 		 149 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  32.5 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  34.82 
 
 		 274 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  34.82 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.5 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.5 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.5 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.5 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.5 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  33.71 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  36.78 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  30.97 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  33.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  36.78 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  38.55 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  34.48 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  38.55 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  38.55 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  39.51 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.34 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.38 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.23 
 
 		 281 aa  65.5  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  37.35 
 
 		 136 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  30.69 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  30.97 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.08 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  35.19 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  34.62 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.59 
 
 		 251 aa  64.7  0.0000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40.28 
 
 		 659 aa  63.9  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  33.71 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  32.18 
 
 		 260 aa  63.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  35.9 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  35.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  35.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  35.71 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  31.9 
 
 		 276 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  31.9 
 
 		 276 aa  61.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  45.16 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  34.62 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  29.35 
 
 		 275 aa  60.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  34.58 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  34.58 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  28.7 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  28.7 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  33.03 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  28.7 
 
 		 142 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4819  transposase (putative)  28.89 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  35.71 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  31.46 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  33.03 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4190  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4226  hypothetical protein  30.39 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  26.61 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  34.69 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  34.69 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  34.69 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  26.61 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  34.69 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  34.69 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>