More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3240 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3240  transposase  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0381334  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0870  transposase  51.88 
 
 
175 aa  176  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  52.23 
 
 
163 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  52.23 
 
 
163 aa  159  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  44.35 
 
 
272 aa  104  6e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  37.04 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  31.2 
 
 
117 aa  72  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  32.54 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  32.54 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  36.11 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  37.04 
 
 
116 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  34.88 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  34.88 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  34.88 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0199  hypothetical protein  39.56 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.703723  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  33.68 
 
 
124 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
158 aa  60.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.22 
 
 
252 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.22 
 
 
252 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  30.58 
 
 
258 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  36.9 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  36.67 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  35.48 
 
 
147 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  36.67 
 
 
252 aa  57  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3483  transposase, IS4 family protein  31.11 
 
 
275 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.274203  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  31.31 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3116  transposase IS4 family protein  39.53 
 
 
274 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  27.7 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  30.3 
 
 
119 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4596  transposase IS4 family protein  31.18 
 
 
184 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  34.34 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  34.34 
 
 
124 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  34.34 
 
 
132 aa  54.3  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0073  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0080  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0169  transposase  30.16 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.103763  normal  0.681722 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0800  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1018  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1364  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.906746  normal  0.0592245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2641  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.865497  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3317  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000684443  normal  0.351726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3800  transposase  35.71 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176127  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.94 
 
 
281 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7507  putative transposase  34.33 
 
 
122 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7421  transposase IS4 family protein  40 
 
 
275 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.720449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.94 
 
 
281 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  26.61 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  26.61 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  34.02 
 
 
155 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0100  hypothetical protein  37.63 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  30.53 
 
 
159 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0045  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0137  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0216  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0328  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.833285  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0456  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.41925  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0517  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0546  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.259245  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0588  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0646  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0910  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.972409  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0920  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0933  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.464119  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1225  IS5 family transposase OrfA  40.85 
 
 
126 aa  51.6  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.338944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.21 
 
 
281 aa  51.6  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  32.63 
 
 
124 aa  51.6  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  35.44 
 
 
276 aa  51.6  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  33.57 
 
 
260 aa  51.2  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  27.21 
 
 
281 aa  51.2  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 
270 aa  50.8  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1440  transposase  34.52 
 
 
129 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.624391 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2487  transposase  34.52 
 
 
129 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0893  transposase  35.16 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.500999  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  31.91 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  31.91 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  36.73 
 
 
255 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3690  transposase, IS4 family protein  35.29 
 
 
274 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241824  normal  0.0110371 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1109  transposase and inactivated derivative  37.63 
 
 
122 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.194071  normal  0.208804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4666  IS298, transposase OrfA  34.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.159074  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4714  IS298, transposase OrfA  34.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2618  IS298, transposase OrfA  34.88 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.755097  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1125  transposase and inactivated derivative  36.56 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00135223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>