More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1717 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  100 
 
 
150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  68 
 
 
149 aa  207  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  67.11 
 
 
149 aa  206  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  72.65 
 
 
136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  70.83 
 
 
136 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  70.83 
 
 
136 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  70 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  62.41 
 
 
136 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  67.5 
 
 
136 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  73.58 
 
 
136 aa  176  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  72.64 
 
 
136 aa  174  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  48.19 
 
 
123 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  46.99 
 
 
117 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  40.57 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  40.57 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  40.57 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  32.64 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  42.35 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  38 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  42.55 
 
 
133 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  42.86 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  39.56 
 
 
373 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  41.49 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  39.56 
 
 
390 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  39.13 
 
 
334 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  39.13 
 
 
310 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  36.54 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  36.54 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  41.76 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  36.54 
 
 
132 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  41.76 
 
 
132 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  41.76 
 
 
290 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  38.04 
 
 
314 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  34.62 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.71 
 
 
252 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.51 
 
 
158 aa  73.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  34.86 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  33.04 
 
 
121 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  33.04 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  33.04 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  34.86 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  34.86 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  31.71 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  37.21 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  37.8 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.5  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  32.14 
 
 
121 aa  70.1  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.8 
 
 
281 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>