More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1347 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  100 
 
 		 229 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  83.84 
 
 		 223 aa  347  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  60.16 
 
 		 132 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  60.47 
 
 		 133 aa  152  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  60.94 
 
 		 132 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  60.47 
 
 		 133 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  60.94 
 
 		 132 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  48.53 
 
 		 438 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  49.63 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  50 
 
 		 334 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  47.76 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  48.92 
 
 		 401 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  47.76 
 
 		 314 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  46.32 
 
 		 313 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  47.37 
 
 		 390 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  46.32 
 
 		 313 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  46.32 
 
 		 313 aa  118  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  47.73 
 
 		 310 aa  118  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  48.51 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  47.48 
 
 		 391 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  41.67 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  45.86 
 
 		 283 aa  99.4  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  41.73 
 
 		 149 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  38.76 
 
 		 149 aa  85.5  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  45.88 
 
 		 136 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  45.88 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  42.86 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  45.88 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  44.71 
 
 		 136 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  41.76 
 
 		 150 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  45.88 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  45.88 
 
 		 136 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  39.81 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  35.96 
 
 		 123 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  38.89 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  38.27 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  37.65 
 
 		 149 aa  62  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  38.27 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  33.33 
 
 		 117 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  38.27 
 
 		 122 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5541  putative insertion element transposase  42.5 
 
 		 87 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73359  normal  0.563993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  37.07 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  37.07 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  37.07 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  37.21 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.68 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  33.33 
 
 		 119 aa  57.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  38.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  38.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  38.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  38.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  38.27 
 
 		 123 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  40.48 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2961  transposase IS4 family protein  34.62 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  32.08 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  39.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  39.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.59 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  39.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  39.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  39.24 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  41.3 
 
 		 277 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.59 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  32.26 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3887  transposase and inactivated derivatives-like  36.56 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1756  transposase, IS4 family protein  35.4 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000595151  normal  0.154833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4034  transposase, IS4 family protein  37.25 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000467614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  38.71 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  38.71 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  38.71 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  36.78 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>