More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1739 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  248  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  248  2e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  63.03 
 
 
119 aa  166  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0516  hypothetical protein  82.42 
 
 
104 aa  166  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.142915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3088  hypothetical protein  62.18 
 
 
119 aa  165  2e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0452769  normal  0.0619114 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  61.47 
 
 
139 aa  152  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  36.28 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.9 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  34.21 
 
 
277 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1378  putative transposase  33.33 
 
 
157 aa  67.4  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.16406  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  38.46 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  35.45 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  38.46 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  38.46 
 
 
121 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  28.3 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  33.04 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  31.48 
 
 
260 aa  64.3  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  35.9 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  34.23 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  34.23 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  34.23 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  34.23 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  34.23 
 
 
123 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.57 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7818  putative transposase  26.96 
 
 
142 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  37.66 
 
 
272 aa  62.8  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4170  transposase  30.84 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3797  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.89 
 
 
659 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.622251 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  35.71 
 
 
147 aa  62  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7025  hypothetical protein  32.26 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0502203  normal  0.0741238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  28.95 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  62  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  37.18 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  37.18 
 
 
124 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  37.18 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  29.66 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  29.66 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  31.25 
 
 
260 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1074  transposase IS4 family protein  30.69 
 
 
275 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  29.2 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  30.28 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  33.71 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6451  hypothetical protein  31.25 
 
 
273 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112663  normal  0.335416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1754  transposase  25.89 
 
 
159 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.356095  normal  0.53027 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0771  hypothetical protein  31.43 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  32.74 
 
 
276 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  30 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  31.82 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  32.74 
 
 
276 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  33.33 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.91 
 
 
281 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2931  transposase  35.9 
 
 
157 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.30036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  33.33 
 
 
229 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  36.36 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  36.36 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  36.36 
 
 
104 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20970  transposase  31.58 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13900  transposase  31.58 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  35.4 
 
 
268 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0286  transposase  27.96 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0497  transposase  27.96 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0373343  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  32.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  32.41 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  32.41 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  32.41 
 
 
260 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  34.52 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2835  hypothetical protein  32 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  32.56 
 
 
281 aa  57  0.00000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06950  hypothetical protein  27.47 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06880  hypothetical protein  27.47 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0485917  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  33.02 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  33.02 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  32.41 
 
 
260 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>