More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1406 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  100 
 
 		 276 aa  544  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  89.01 
 
 		 274 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  88.45 
 
 		 277 aa  441  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  53.46 
 
 		 268 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  46.51 
 
 		 258 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  53.1 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  53.1 
 
 		 268 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  55.43 
 
 		 268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  50.94 
 
 		 268 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  50 
 
 		 267 aa  209  4e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  49.62 
 
 		 268 aa  208  7e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  49.24 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0522  transposase, IS4 family protein  59.62 
 
 		 170 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0847  transposase, IS4 family protein  59.62 
 
 		 170 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3790  transposase, IS4 family protein  59.62 
 
 		 170 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.541543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0093  transposase, IS4 family protein  58.33 
 
 		 173 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1908  transposase, IS4 family protein  58.33 
 
 		 173 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.221251  decreased coverage  0.000248435 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  35.74 
 
 		 272 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2025  transposase, IS4  57.52 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0067  putative transposase IS4  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.724266 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0563  putative IS4 transposase protein B  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.937128  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2483  IS4 family transposase  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.929772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3510  putative transposase  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.291639 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4296  putative transposase, IS4  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000110159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4457  putative transposase  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2711  putative transposase  48.1 
 
 		 209 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17380  transposase family protein  47.55 
 
 		 144 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0402  transposase, IS4  56.21 
 
 		 216 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.79 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.07 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.79 
 
 		 281 aa  133  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  31.43 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1671  TIS1421-transposase protein B  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0971457  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0042  TIS1421-transposase protein B  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0093  TIS1421-transposase protein B  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0301  TIS1421-transposase protein A  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00123351 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0582  IS1421-transposase protein B  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0991  TIS1421-transposase protein B  52.03 
 
 		 128 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.308631  normal  0.0376658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  56.19 
 
 		 134 aa  123  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1734  transposase, IS4 family protein  53.78 
 
 		 140 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355077 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7677  transposase IS4 family protein  45.95 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6412  IS4 family transposase  44.59 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.510008  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6468  IS4 family transposase  44.59 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.572401  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1566  IS4 family transposase  44.59 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5785  transposase IS4 family protein  45.45 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  49.22 
 
 		 147 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.27 
 
 		 141 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25860  transposase  31.39 
 
 		 303 aa  116  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  52.34 
 
 		 136 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  52.34 
 
 		 136 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  52.34 
 
 		 136 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  31.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2623  hypothetical protein  70.16 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  31.39 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  50 
 
 		 147 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  53.98 
 
 		 139 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3860  transposase IS4 family protein  31.84 
 
 		 291 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0247596  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  50.47 
 
 		 141 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1898  transposase IS4 family protein  31.46 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1847  transposase IS4 family protein  31.46 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3622  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968819  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3631  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0411326  normal  0.17845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1726  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2047  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2524  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0824327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3094  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0335819  normal  0.853001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3722  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0136631  hitchhiker  0.000781159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4477  transposase, IS4 family protein  53.27 
 
 		 112 aa  108  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.164245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4264  hypothetical protein  31.54 
 
 		 280 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1197  transposase IS4 family protein  34.69 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2123  transposase IS4 family protein  34.69 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.461736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2979  transposase IS4 family protein  34.69 
 
 		 295 aa  105  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3738  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.32 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5629  insertion sequence, putative  33.01 
 
 		 244 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5636  hypothetical protein  31.95 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3783  hypothetical protein  31.95 
 
 		 252 aa  98.6  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.155847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3788  transposase, IS4  34.55 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0999364  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  29.29 
 
 		 294 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2998  transposase, IS4  33.09 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.60831  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  31.09 
 
 		 260 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4642  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.97 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.555712 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3969  Transposase and inactivated derivatives-like protein  30.97 
 
 		 252 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4475  hypothetical protein  29.96 
 
 		 259 aa  95.5  9e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6401  hypothetical protein  31.2 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6448  putative transposase  31.2 
 
 		 251 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1298  transposase IS4 family protein  31.97 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0173  transposase, IS4 family protein  39.67 
 
 		 123 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>