More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0041 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 134 aa  268  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  66.91 
 
 		 141 aa  188  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.92 
 
 		 139 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  65.44 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  65.44 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  65.44 
 
 		 136 aa  183  6e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  62.22 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  56.78 
 
 		 268 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  52.17 
 
 		 277 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  51.3 
 
 		 274 aa  122  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  54.55 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  53.64 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  54.55 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  55.08 
 
 		 268 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  55.08 
 
 		 268 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  46.77 
 
 		 147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  65.79 
 
 		 101 aa  107  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  46.36 
 
 		 258 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  48.65 
 
 		 268 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  51.65 
 
 		 268 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  53.49 
 
 		 267 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  68.25 
 
 		 64 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  44.17 
 
 		 268 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  36.84 
 
 		 272 aa  86.7  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  46.36 
 
 		 268 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  46.59 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.72 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.72 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.72 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.72 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.72 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.96 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.04 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.78 
 
 		 281 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  33.91 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  36.11 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1739  hypothetical protein  36.28 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1329  hypothetical protein  36.28 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  38.79 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  38.79 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.94 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  37.72 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  39.81 
 
 		 117 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  36.09 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  38.05 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  38.05 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  37.72 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.68 
 
 		 252 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  36.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  36.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  36.59 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4945  transposase  34.43 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4964  transposase  34.43 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0783623 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  36.52 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4329  ISPs1, transposase OrfA  35.9 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2681  hypothetical protein  30.7 
 
 		 119 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0215998  normal  0.133085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  34.96 
 
 		 135 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  34.96 
 
 		 129 aa  70.1  0.000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0667  hypothetical protein  31.03 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  34.96 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  34.96 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  35.96 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  42.05 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  42.5 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>