More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1205 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  100 
 
 		 139 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  76.92 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  76.27 
 
 		 141 aa  184  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  69.23 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  69.23 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  69.23 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  70.83 
 
 		 141 aa  171  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  55.26 
 
 		 268 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  48.82 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  52.63 
 
 		 274 aa  113  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  53.98 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  53.98 
 
 		 276 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  47.24 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  50.88 
 
 		 277 aa  110  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  62.2 
 
 		 268 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  62.2 
 
 		 268 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  74.24 
 
 		 101 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  42.11 
 
 		 258 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  73.02 
 
 		 64 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  51.16 
 
 		 268 aa  90.1  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  51.76 
 
 		 267 aa  90.1  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  45.71 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  48.65 
 
 		 268 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  47.47 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  39.47 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02821  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02157  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05896  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02894  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05986  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05842  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05085  hypothetical protein  38.33 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06086  hypothetical protein  38.05 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35 
 
 		 281 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05998  hypothetical protein  37.5 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.78 
 
 		 281 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04735  hypothetical protein  39.47 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.86 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.86 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1743  transposase  36.28 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.331914  normal  0.677394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3633  transposase  36.28 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0497794 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  35.77 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  32.11 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2176  transposase and inactivated derivatives-like protein  45.07 
 
 		 114 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  31.67 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  37.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  37.93 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  41.38 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  41.38 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01097  hypothetical protein  44.3 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0087  Transposase-like protein  42.35 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.17 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  35.78 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  35.78 
 
 		 135 aa  62.8  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  37.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  37.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  37.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  37.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  37.08 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  43.59 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  40 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  40 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  40 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  40 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  40 
 
 		 254 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  40.91 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0077  transposase  40.23 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  34.86 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  40.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  34.86 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  40.23 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  40.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  34.86 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  40.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  40.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  34.86 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  34.86 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  34.86 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>