134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1733 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1733  putative TIS1421-transposase orfA protein  100 
 
 
64 aa  133  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334785 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  90.62 
 
 
141 aa  121  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  81.25 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  82.81 
 
 
136 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  82.81 
 
 
136 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  82.81 
 
 
136 aa  111  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1905  hypothetical protein  78.12 
 
 
101 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.519601  normal  0.0126104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  73.02 
 
 
139 aa  94  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  68.25 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  64.71 
 
 
268 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  61.54 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  55.77 
 
 
268 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  55.77 
 
 
268 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  64.58 
 
 
175 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  58 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  49.21 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  58 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  57.69 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  49.21 
 
 
277 aa  65.5  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  57.69 
 
 
268 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  56 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  60.42 
 
 
268 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  60.42 
 
 
268 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  46.03 
 
 
258 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0595  putative transposase  50 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3450  putative transposase  50 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4185  putative transposase  50 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.123129  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  47.06 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  47.06 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  44.44 
 
 
252 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  47.06 
 
 
254 aa  49.7  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  47.06 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  47.83 
 
 
123 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  42.62 
 
 
121 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  46.94 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  46.94 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  46.94 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  45.1 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  45.1 
 
 
142 aa  47.4  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0527  ISBm1, transposase orfA  44.07 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0537  ISBm1, transposase orfA  44.07 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  44.9 
 
 
103 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2661  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0335597  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2821  ISBm1, transposase orfA  43.14 
 
 
87 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7770  hypothetical protein  32.79 
 
 
255 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885835  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0594  transposase  42.86 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2467  transposase  42.86 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193049  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4641  transposase  42.86 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4661  transposase  42.86 
 
 
260 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  43.14 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4095  putative insertion element (IS) transposase  36.51 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.619216  normal  0.812297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1322  transposase  38.1 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6151  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.777281  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6259  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.147576 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3519  putative transposase  32.79 
 
 
251 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.343195  normal  0.0901515 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  46.51 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2514  putative transposase  44.68 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00370  transposase  32.81 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.632263  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  33.33 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05130  transposase  32.81 
 
 
303 aa  43.1  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3828  transposase  34.92 
 
 
260 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>