176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6624 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6624  TIS1421-transposase protein A  100 
 
 		 120 aa  246  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.29117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1672  TIS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0647386  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0041  TIS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0094  TIS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0302  TIS1421-transposase protein B  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0581  IS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0990  TIS1421-transposase protein A  35.59 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.118186  normal  0.0722449 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6465  hypothetical protein  38.55 
 
 		 268 aa  62  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  33.9 
 
 		 438 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0760  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00106619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1406  hypothetical protein  31.3 
 
 		 276 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  32.14 
 
 		 274 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  32.41 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1205  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.91 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.482894  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0172  transposase and inactivated derivatives-like protein  32.71 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1843  hypothetical protein  39.19 
 
 		 267 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2603  hypothetical protein  38.16 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.144374  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3471  hypothetical protein  38.16 
 
 		 268 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3527  hypothetical protein  39.19 
 
 		 268 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2753  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  36.14 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  36.14 
 
 		 390 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  36.14 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6398  hypothetical protein  32.69 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2048  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3991  transposase and inactivated derivatives-like  29.25 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3623  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.111162  normal  0.0945006 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3630  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.033265  normal  0.188786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3095  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0214138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4478  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167021 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3723  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0053926  hitchhiker  0.000867735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2523  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.143828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1727  putative TIS1421-transposase orfA protein  28.93 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23130  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14740  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.421882  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21790  transposase  31.3 
 
 		 135 aa  53.9  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.406801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14940  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0421984  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06550  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.244138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14830  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.227198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15010  transposase  31.3 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.658905  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5632  hypothetical protein  29.17 
 
 		 268 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.346218  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  35.23 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  35.23 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  35.23 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  35.23 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  35.23 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  40.24 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  40.24 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  40.24 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  37.89 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5581  hypothetical protein  37.31 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0704355 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5590  hypothetical protein  37.31 
 
 		 268 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.634416  normal  0.0110915 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0523  putative TIS1421-transposase orfA protein  30.21 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0848  putative TIS1421-transposase orfA protein  30.21 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120469 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3789  putative TIS1421-transposase orfA protein  30.21 
 
 		 136 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.133971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06530  transposase  30.43 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.293391  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02000  transposase  30.43 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  50.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  32.93 
 
 		 310 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  31.11 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  36.96 
 
 		 401 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  30.68 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  36.96 
 
 		 391 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2280  putative TIS1421-transposase orfA protein  31.18 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.676349  normal  0.0212696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  32.93 
 
 		 314 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  30 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  31.65 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  31.71 
 
 		 313 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  32.93 
 
 		 313 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  29.55 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4818  ISPs1, transposase OrfA  31.48 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.886393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  30.49 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4824  ISPs1, transposase OrfA  31.48 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  27.68 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  29.52 
 
 		 281 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>