More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1394 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  99.26 
 
 		 136 aa  283  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  92.65 
 
 		 136 aa  265  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  91.91 
 
 		 136 aa  264  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  91.18 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  91.18 
 
 		 136 aa  262  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  77.94 
 
 		 136 aa  227  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  64.18 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  184  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  61.76 
 
 		 136 aa  183  9e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  63.28 
 
 		 149 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  60.94 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  74.76 
 
 		 150 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  45.98 
 
 		 123 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  45.98 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  44.66 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  45 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  45 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  45.35 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  45.88 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  45.88 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  45.88 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  45.88 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  45.78 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  42.05 
 
 		 390 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  43.75 
 
 		 310 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  37.29 
 
 		 139 aa  79.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  42.05 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  42.05 
 
 		 334 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  42.05 
 
 		 334 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  33.61 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  40.91 
 
 		 313 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  33.61 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  33.61 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  45.24 
 
 		 438 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  42.17 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  35.9 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  35.9 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  35.9 
 
 		 121 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  42.17 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  41.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  41.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  41.25 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  34.55 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  42.86 
 
 		 401 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.92 
 
 		 252 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  42.86 
 
 		 391 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  35.14 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  35.14 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  35.14 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  35.14 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  35.14 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  34.75 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  39.51 
 
 		 149 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  34.29 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  34.29 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  34.29 
 
 		 123 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.92 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.92 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.92 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.92 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.92 
 
 		 254 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  35.83 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  35.83 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  35.83 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  35.83 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  35.83 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  35.83 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>