More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6232 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  100 
 
 
290 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7183  putative transposase A-like protein  47.01 
 
 
283 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0173089  normal  0.690368 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  40.79 
 
 
401 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  41.38 
 
 
334 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  41.38 
 
 
334 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  41.38 
 
 
334 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  41.38 
 
 
334 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  41.38 
 
 
334 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  42.64 
 
 
310 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  39.93 
 
 
373 aa  185  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  41.03 
 
 
334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  40.65 
 
 
390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  40.8 
 
 
391 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  38.95 
 
 
314 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  41.39 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  41.39 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  41.39 
 
 
313 aa  177  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  38.95 
 
 
313 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  39.19 
 
 
313 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  43.17 
 
 
438 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  41.67 
 
 
229 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  41.67 
 
 
229 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  41.67 
 
 
210 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  41.48 
 
 
132 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  39.69 
 
 
132 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  39.1 
 
 
132 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  39.1 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  40.74 
 
 
133 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  41.61 
 
 
223 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  36.7 
 
 
136 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  41.94 
 
 
149 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  41.76 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  41.76 
 
 
150 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  44.3 
 
 
136 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  37.07 
 
 
136 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  38.46 
 
 
136 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  37.36 
 
 
136 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  33.64 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.71 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.71 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.71 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.71 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.71 
 
 
254 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2587  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2584  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.423769  normal  0.406364 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2739  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0801095  normal  0.030569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0172  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0377128 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2727  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820698  normal 
 
 
-
 
NC_011367  Gdia_3564  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1666  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.577302  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1593  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.584894  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1726  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1786  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0265286  normal  0.685085 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2391  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2658  transposase IS5 family protein  35.56 
 
 
278 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.623806  normal  0.114788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  36.59 
 
 
132 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  39.51 
 
 
126 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  36.59 
 
 
132 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  36.14 
 
 
123 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  34.52 
 
 
254 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2732  transposase IS4 family protein  29 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1382  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00156039  hitchhiker  0.00320613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2601  hypothetical protein  40.74 
 
 
274 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0182939  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1387  transposase IS5 family protein  32.32 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  33.33 
 
 
142 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  38.55 
 
 
121 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  38.55 
 
 
121 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  38.55 
 
 
121 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1346  transposase  34.15 
 
 
272 aa  56.6  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.566826  normal  0.888683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>