More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1488 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  283  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  99.26 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  99.26 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  92.65 
 
 
136 aa  266  5.9999999999999995e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  91.91 
 
 
136 aa  251  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  91.18 
 
 
136 aa  250  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  79.41 
 
 
136 aa  228  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  68.55 
 
 
136 aa  186  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  63.24 
 
 
136 aa  186  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  63.36 
 
 
149 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  76.7 
 
 
150 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  60.31 
 
 
149 aa  174  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  47.19 
 
 
123 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  43.68 
 
 
117 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  44.66 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  45.05 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  45.05 
 
 
132 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  43.62 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  45.88 
 
 
210 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  43.96 
 
 
132 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  45.88 
 
 
223 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  45.88 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  45.88 
 
 
229 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  42.05 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  42.05 
 
 
390 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  42.05 
 
 
334 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  39.13 
 
 
310 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  41.98 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  44.71 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.92 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  38.04 
 
 
314 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  42.35 
 
 
121 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  43.53 
 
 
401 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  33.33 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  32.77 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  32.77 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  32.77 
 
 
123 aa  75.5  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  38.04 
 
 
313 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  43.53 
 
 
391 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  33.33 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  33.33 
 
 
121 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  38.46 
 
 
290 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  31.3 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  31.3 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  31.3 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  31.3 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  31.3 
 
 
123 aa  73.9  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  37.25 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  33.04 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  32.52 
 
 
121 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  35.92 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  35.92 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  35.92 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  35.92 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  35.92 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  34.51 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.51 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  35.19 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  35.19 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  35.19 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  35.19 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>