More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2785 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  100 
 
 
123 aa  253  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  87.13 
 
 
117 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  46.53 
 
 
136 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  49.43 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  47.13 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  47.67 
 
 
150 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  47.13 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  45.98 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  47.19 
 
 
136 aa  89  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  44.83 
 
 
136 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  44.83 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  44.83 
 
 
136 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  43.68 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  43.21 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  43.21 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  43.21 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  43.21 
 
 
123 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6488  transposase  39.56 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.659219  normal  0.853863 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0292  putative transposase  39.58 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.4660800000000001e-26  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7669  transposase  37.36 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.748537  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7093  transposase  37.36 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.878817  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.1 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1157  transposase  37.36 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3213  Transposase and inactivated derivatives-like protein  43.37 
 
 
281 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2686  putative IS1648 transposase  39.51 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1126  ISBm1, transposase orfA  36.26 
 
 
142 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  43.21 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6478  transposase  36.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.525266 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6168  transposase  36.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6167  transposase  36.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6118  transposase  36.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770853 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6137  transposase  36.26 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.876431 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  43.21 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  43.21 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0214  Transposase and inactivated derivatives-like protein  37.63 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4088  Transposase and inactivated derivatives-like protein  40.96 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  40.74 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  38.2 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  35.96 
 
 
210 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  35.96 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  38.27 
 
 
390 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  35.96 
 
 
229 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1224  Transposase and inactivated derivatives-like protein  39.76 
 
 
281 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  38.27 
 
 
373 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  41.1 
 
 
252 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  38.27 
 
 
334 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2971  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.213916 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  39.51 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  39.51 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  39.51 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  41.03 
 
 
121 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2954  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2172  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10979  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2604  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656707  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0367  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.350235  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21600  transposase  34.94 
 
 
294 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.507901  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0705  transposase  35.16 
 
 
254 aa  62.8  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0523  ISBm1, transposase orfA  35.16 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0533  ISBm1, transposase orfA  35.16 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0168543  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0249  ISBm1, transposase orfA  38.96 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00124682  hitchhiker  0.00649227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2678  ISBm1, transposase orfA  38.96 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.272123  normal  0.0958121 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  39.51 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  39.51 
 
 
132 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  39.51 
 
 
133 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.631309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>