More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1434 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1434  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  285  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00387753  normal  0.0246951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1394  hypothetical protein  99.26 
 
 		 136 aa  283  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.997905  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4653  hypothetical protein  91.91 
 
 		 136 aa  264  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.385837  normal  0.225605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1488  hypothetical protein  91.18 
 
 		 136 aa  263  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187879  hitchhiker  0.000281103 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1032  hypothetical protein  90.44 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.703419  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1512  hypothetical protein  90.44 
 
 		 136 aa  261  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1743  hypothetical protein  77.21 
 
 		 136 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000514492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1047  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.128827  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1004  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0627317  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1777  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.321393  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1755  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0162  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1494  hypothetical protein  63.43 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1928  hypothetical protein  62.69 
 
 		 136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.643232  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2552  hypothetical protein  61.03 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.248295  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1644  putative transposase protein  62.5 
 
 		 149 aa  175  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal  0.304361 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1717  putative transposase protein  73.79 
 
 		 150 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2808  putative transposase protein  60.16 
 
 		 149 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164192  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2785  putative transposase  47.13 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6770  putative transposase  47.13 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0648258  normal  0.255889 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1625  putative transposase A protein  43.69 
 
 		 133 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.081408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2827  putative transposase A protein  44 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1736  putative transposase A protein  44 
 
 		 132 aa  84  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0757752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1469  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1415  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.631309 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4634  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.578945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1012  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1375  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1493  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1762  hypothetical protein  44.19 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.695632  normal  0.0625583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1069  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1482  hypothetical protein  44.71 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1909  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.555093  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2570  ISBm1, transposase orfA, interruption-N  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.231556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0181  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000811321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1756  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.706224  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0985  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1734  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1513  hypothetical protein  44.58 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2884  hypothetical protein  44.71 
 
 		 223 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1347  putative transposase  44.71 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1340  putative transposase  44.71 
 
 		 229 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0252  putative transposase  37.29 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4921  hypothetical protein  42.5 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0271882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0920  hypothetical protein  40.91 
 
 		 373 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.254793  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0541  hypothetical protein  40.91 
 
 		 390 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2488  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0271  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.852206  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0303  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1648  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2626  transposase  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1451  hypothetical protein  40.91 
 
 		 334 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4160  putative transposase  36.75 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6137  putative transposase  36.75 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1108  putative transposase  36.75 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2278  hypothetical protein  39.77 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0815679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1055  putative transposase A-like protein  44.05 
 
 		 438 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.733462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1397  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0173468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2920  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.611545 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2922  ISBm1, transposase orfA  32.79 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3721  hypothetical protein  40.96 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.313369  normal  0.0880548 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5544  hypothetical protein  40.96 
 
 		 313 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.152908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3706  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4545  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3818  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.546084 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2249  putative transposase A-like protein  41.67 
 
 		 401 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.909446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3793  Transposase and inactivated derivatives-like protein  34.95 
 
 		 252 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.183907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6232  putative transposase A-like protein  33.64 
 
 		 290 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.489662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0365  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.631873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1358  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299376  normal  0.593185 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1718  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.000911297  normal  0.283895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1953  putative transposase A-like protein  41.67 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.520795 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0309  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.801441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0842  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00387238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1096  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.274857 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1292  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.699316  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1297  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2224  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.1161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2412  ISBm1, transposase orfA  31.97 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0007  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal  0.178212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0181  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.65132  normal  0.571083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2346  ISPs1, transposase OrfA  34.75 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0972  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1283  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.2132  normal  0.263939 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1289  transposase  36.67 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1591  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.602434 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2474  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2499  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.71476  normal  0.311216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2823  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2862  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2925  transposase  36.67 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3014  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3038  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3115  transposase  36.67 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0735642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2808  putative transposase  34.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0005  putative transposase  34.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5873  Transposase and inactivated derivatives-like protein  35.48 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000924968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2660  putative transposase  34.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.521609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4348  putative transposase  34.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal  0.530207 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1590  putative transposase  34.23 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.587104  normal  0.760302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>